本文關鍵詞： 絨山羊 毛囊 轉錄組 RNA-測序　出處：《家畜生態(tài)學報》2017年11期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為了研究絨山羊皮膚初級毛囊和次級毛囊之間的表達基因模式的差異,篩選影響毛囊發(fā)育的重要基因,對6只內蒙古絨山羊阿爾巴斯型個體進行RNA-seq測序,利用生物信息學方法對轉錄組數(shù)據(jù)進行分析,在測序結果質量控制后的基礎上,對差異表達基因進行篩選、功能注釋和富集分析。共篩選到617個在初級毛囊和次級毛囊中差異表達的基因,其中,上調表達基因297個,下調表達基因320個。GO功能注釋結果顯示,上調表達基因主要行使電子傳遞鏈、呼吸鏈電子傳遞、線粒體電子傳遞、基因表達等生物學功能;下調表達基因主要行使細胞吞噬、蛋白質復性、中性粒細胞聚集、細菌真菌防御反應等生物學功能。利用KEGG數(shù)據(jù)庫作為參考,這些基因主要參與半胱氨酸和蛋氨酸代謝、RNA聚合、RNA可變剪切、底物磷酸化等通路。PPP2R2A和CDK2AP1基因可能在皮膚毛囊發(fā)育中發(fā)揮重要作用,以上結果為今后深入研究皮膚毛囊發(fā)育相關基因及功能提供了依據(jù)。
[Abstract]:In order to study the difference of gene expression patterns between primary hair follicles and secondary hair follicles of cashmere goats, and to screen the important genes affecting the development of hair follicles, RNA-seq sequencing was carried out in 6 individuals of Albanian type in Inner Mongolia Cashmere Goat (Inner Mongolia Cashmere Goat). The transcriptome data were analyzed by bioinformatics, and the differentially expressed genes were screened on the basis of quality control of sequencing results. Functional annotation and enrichment analysis. A total of 617 differentially expressed genes were screened in primary hair follicles and secondary follicles, of which 297 genes were up-regulated and 320 down-regulated genes. The up-regulated genes mainly perform the biological functions of electron transfer chain, respiratory chain electron transport, mitochondrial electron transport, gene expression, etc. The down-regulated genes mainly perform phagocytosis, protein renaturation, neutrophil aggregation, etc. Using the KEGG database as a reference, these genes are mainly involved in the metabolism of cysteine and methionine. The phosphorylation of substrates. PPP2R2A and CDK2AP1 genes may play an important role in the development of skin hair follicles. These results provide a basis for the further study of the genes and functions related to the development of skin hair follicles.
【作者單位】： 內蒙古農(nóng)業(yè)大學動物科學學院;動物遺傳育種與繁殖自治區(qū)重點實驗室;農(nóng)業(yè)部肉羊遺傳育種重點實驗室;
【基金】：國家絨毛用羊現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術體系項目(CARS-39-06) 國家自然科學基金(31660639)
【分類號】：S827

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