鴨源大腸桿菌Ⅰ型菌毛的鑒定及FimA、FimH基因特征分析
發(fā)布時間:2018-02-01 19:20
本文關(guān)鍵詞: 大腸埃希菌 Ⅰ型菌毛 氨基酸 序列比對 抗原表位 出處:《浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報》2017年12期 論文類型:期刊論文
【摘要】:為了解川渝部分地區(qū)鴨源大腸埃希菌Ⅰ型菌毛產(chǎn)生情況及分子特征,采用MSHA/MRHA試驗、PCR擴(kuò)增Ⅰ型菌毛基因(FimA、FimH)進(jìn)行菌毛類型鑒定;通過分析FimA氨基酸序列的親水性、抗原性、表面可及性來預(yù)測抗原位點。MSHA/MRHA試驗結(jié)果顯示,MSHA檢測陽性率為44.3%;PCR檢測FimA陽性率為63.41%,FimH陽性率為100%。氨基酸序列比對結(jié)果顯示:FimA氨基酸序列與比對株大腸埃希菌(ECOR61)相比,存在19個差異位點;FimH氨基酸序列與比對株(ECOR45)相比,僅少數(shù)菌株出現(xiàn)1~2個氨基酸位點差異,表明該片段高度保守。對FimA氨基酸序列進(jìn)行抗原位點預(yù)測,結(jié)果顯示,多數(shù)菌株抗原表位共同區(qū)域分布在84~88、142~146、149~150位氨基酸之間,除上述位點外,部分菌株在101~105、130~134位氨基酸出現(xiàn)抗原表位。
[Abstract]:In order to understand the production and molecular characteristics of Escherichia coli type I pili from ducks in Sichuan and Chongqing regions, the type 鈪,
本文編號:1482669
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