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銀杏兩個(gè)WD40轉(zhuǎn)錄因子基因克隆及序列分析

發(fā)布時(shí)間:2018-01-22 05:05

  本文關(guān)鍵詞: 銀杏 類黃酮 WD轉(zhuǎn)錄因子 基因克隆 出處:《北方園藝》2017年18期  論文類型:期刊論文


【摘要】:WD40轉(zhuǎn)錄因子也稱WDR(WD repeat)蛋白,是一種古老蛋白家族,參與調(diào)節(jié)類黃酮次生代謝途徑中多種酶基因的表達(dá),從而影響類黃酮的積累。以三年生銀杏苗為試材,采用RT-PCR和RACE-PCR方法,研究了銀杏WD40基因序列,以期深入了解銀杏葉類黃酮合成代謝的分子機(jī)理。結(jié)果表明:GbWD401序列包含一段2 313bp的開放閱讀框,編碼一個(gè)770aa的肽鏈;GbWD402序列包含一段1 605bp的開放閱讀框,編碼一個(gè)534aa的肽鏈。銀杏GbWD401和GbWD402基因推測(cè)編碼蛋白序列均含有典型WD40重復(fù)基序。GbWD401蛋白序列與無油樟AtWD401相似性為49%,GbWD402蛋白序列與無油樟AtWD402相似性為78%。系統(tǒng)進(jìn)化樹發(fā)現(xiàn),GbWD401與無油樟AtWD401、荷花NnWD40劃歸為同一分支;而GbWD402與無油樟AtWD402劃歸為另一分支。
[Abstract]:WD40 transcription factor, also known as WDR(WD repeat) protein, is an ancient protein family involved in regulating the expression of many enzyme genes in the secondary metabolism pathway of flavonoids. In order to influence the accumulation of flavonoids, the WD40 gene sequence of three year old Ginkgo biloba seedlings was studied by RT-PCR and RACE-PCR. In order to understand the molecular mechanism of flavonoid biosynthesis in Ginkgo biloba leaves, the results showed that the 1: GbWD401 sequence contained an open reading frame of 2313 BP, encoding a peptide chain of 770 AA. The GbWD402 sequence contained a 1 605bp open reading frame. It encodes a 534aa peptide chain. The deduced protein sequences of GbWD401 and GbWD402 genes of Ginkgo biloba contain typical WD40 repeat motif. GbWD401 protein sequence and Cinnamomum camphora A protein sequence. TWD401 similarity was 49%. The similarity between GbWD402 protein sequence and AtWD402 was 78. GbWD401 and AtWD401 were found in phylogenetic tree. NnWD40 of lotus flower was classified as the same branch; GbWD402 and Cinnamomum camphora AtWD402 were classified as another branch.
【作者單位】: 武漢輕工大學(xué)生物與制藥工程學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31270717,31400556) 湖北省自然科學(xué)重點(diǎn)資助項(xiàng)目(2013BHE029)
【分類號(hào)】:Q943.2;S792.95
【正文快照】: 銀杏(Ginkgo biloba L.)屬裸子植物銀杏科銀杏屬落葉喬木,又名白果、公孫樹[1]。銀杏葉具有很高藥用價(jià)值,其主要有效成分為類黃酮和萜內(nèi)酯。類黃酮是一類以C6-C3-C6為基本結(jié)構(gòu)或具有苯基苯并吡喃結(jié)構(gòu)的植物次生代謝物[2],銀杏葉中類黃酮主要包括單黃酮、雙黃酮、兒茶素等三大

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