本文關(guān)鍵詞： PsMBD RACE 生物信息學(xué)分析 表達特性　出處：《華北農(nóng)學(xué)報》2017年02期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：前期通過轉(zhuǎn)錄組結(jié)合表達譜分析發(fā)現(xiàn)一類MBD片段在低溫解除牡丹花芽內(nèi)休眠中的差異表達,為了進一步研究MBD基因特征及其在牡丹休眠解除中的作用,利用RACE擴增獲得1204bpPsMBD5全長cDNA,其中編碼框1056bp,推測編碼351個氨基酸。生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示,PsMBD5蛋白分子量約為38.1274kDa,等電點為5.14,不穩(wěn)定系數(shù)為44.27,推測該蛋白為不穩(wěn)定蛋白。同源性分析表明,牡丹PsMBD5與梅PmMBD5的同源性最高,為38.1%,與亞麻薺CsMBD5的同源性最低,為25.8%,與13種擬南芥MBD蛋白同源性最高的是AtMBD5。實時熒光定量PCR分析表明,PsMBD5基因在牡丹不同組織中均有表達,在初花期牡丹的根中轉(zhuǎn)錄水平最高,在花瓣、心皮和萼片中次之,在雄蕊中最低;PsMBD5基因在牡丹花芽中受低溫誘導(dǎo),且轉(zhuǎn)錄水平在低溫處理14d時達到最大值,之后維持較高的轉(zhuǎn)錄水平。研究結(jié)果為進一步解析PsMBD5基因?qū)δ档せㄑ康男菝呓獬恼{(diào)控機制奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:In order to further study the characteristics of MBD gene and its role in dormancy release of peony, the differential expression of a class of MBD fragments was found in the early stage by transcriptome binding expression analysis in order to further study the characteristics of MBD gene and its role in dormancy release of peony buds at low temperature. The full-length cDNAof 1204bpPsMBD5 was obtained by RACE amplification, and the encoding frame 1056bpwas deduced to encode 351 amino acids. The molecular weight of PsMBD5 protein was about 38.1274 kDa, the isoelectric point was 5.14, and the coefficient of instability was 44.27. The homology between PsMBD5 and PmMBD5 was the highest (38. 1), and the homology with CsMBD5 was 25.8%. The highest homology with 13 Arabidopsis thaliana MBD proteins was AtMBD5.The real-time fluorescence quantitative PCR analysis showed that the PsMBD5 gene was expressed in different tissues of Paeonia suffruticosa. The transcription level was the highest in the roots of peony at the beginning of flowering, followed by petal, carpels and sepals, and the lowest in stamens. The PsMBD5 gene was induced by low temperature in the bud of Peony, and the transcription level reached the maximum at 14 days after low temperature treatment. The results laid a foundation for further analysis of the regulation mechanism of PsMBD5 gene on dormancy release of peony bud.
【作者單位】： 青島農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院山東省高校植物生物技術(shù)重點實驗室;青島農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)與植保學(xué)院;
【基金】：國家自然基金面上項目(31471908;31372104)
【分類號】：S685.11
【正文快照】： DNA甲基化現(xiàn)象是DNA主要的一種表觀遺傳修飾,在植物的生長發(fā)育、花芽分化、非生物脅迫、基因組防御、基因表達調(diào)控等方面發(fā)揮著重要作用[1]。DNA甲基結(jié)合域(Methyl-binding domain,MBD)蛋白是一類轉(zhuǎn)錄因子,與甲基化DNA結(jié)合有關(guān),在DNA甲基化依賴的基因調(diào)控過程中起作用[2]。近

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本文編號：1449680