本文關(guān)鍵詞：安陽地區(qū)2013年手足口病柯薩奇病毒A6 VP1基因特征研究　出處：《病毒學(xué)報(bào)》2016年03期 　論文類型：期刊論文

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【摘要】：為了解2013年安陽地區(qū)手足口病病原譜組成特點(diǎn)及柯薩奇病毒A6(CV-A6)VP1基因特征,采用實(shí)時(shí)熒光逆轉(zhuǎn)錄PCR方法對全年采集的臨床手足口病例的479份糞便標(biāo)本進(jìn)行檢測和分型,統(tǒng)計(jì)各型腸道病毒陽性標(biāo)本數(shù)量及比例。對10份CV-A6陽性標(biāo)本VP1基因進(jìn)行擴(kuò)增測序以獲得全序列。使用BIOEDIT 7.2和MEGA 5.1軟件對獲得序列和NCBI數(shù)據(jù)庫中檢索到的參考序列進(jìn)行VP1基因核苷酸、氨基酸相似性及系統(tǒng)發(fā)育分析。研究結(jié)果顯示,檢出腸道病毒陽性標(biāo)本共429份,其中CV-A6陽性標(biāo)本為90份,占全部陽性標(biāo)本的比例為20.98%,這是安陽地區(qū)首次記錄非CV-A16和EV-A71型腸道病毒列居手足口病病原譜第二位,成為手足口病主要病原之一。將成功獲得的10條VP1序列與CV-A6原型株Gdula比較,發(fā)現(xiàn)安陽序列與Gdula VP1基因的核苷酸、氨基酸序列差異皆較大。與河南歷史株HN421(2011)比較,發(fā)現(xiàn)有4條本地序列與HN421的核苷酸、氨基酸序列差異較大,其余6條與HN421差異較小。系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,全部49條CV-A6序列共形成A、B、C、D四個(gè)分支。其中D分支可進(jìn)一步分為D1和D2兩個(gè)亞分支。安陽地區(qū)獲得的10條CV-A6序列中,有6條屬于D1亞分支,4條屬于D2亞分支。
[Abstract]:Of hand foot and mouth disease in Anyang in 2013 to understand the spectrum and composition characteristics of Coxsackie virus A6 (CV-A6) VP1 gene characteristics, using real-time reverse transcriptase PCR method 479 specimens of the collected clinical HFMD cases were detected and classified, the statistics of enterovirus positive samples of the number and proportion of 10 CV-A6. The positive samples of VP1 gene was amplified and sequenced to obtain complete sequence. Using BIOEDIT 7.2 and MEGA 5.1 software was used to obtain VP1 gene nucleotide sequences and reference sequences retrieved from the NCBI database, the amino acid similarity and phylogenetic analysis. The results showed that the detection of intestinal virus positive samples of 429 cases, including 90 CV-A6 positive samples a total positive ratio of 20.98%, this is the first time in Anyang to record non CV-A16 and EV-A71 enterovirus ranked HFMD pathogens second, become the hand foot and mouth One of the main pathogenic disease. Will successfully obtained 10 VP1 sequences and CV-A6 prototype strains of Gdula, Gdula and VP1 showed that the nucleotide sequence of Anyang gene, amino acid sequence difference is larger. And the history of Henan strain HN421 (2011), there were 4 local sequence and HN421 nucleotide, amino acid sequence differences, the remaining 6 A and HN421 were smaller. The phylogenetic tree showed that all 49 CV-A6 sequences were formed in A, B, C, D four. The D branch branch can be further divided into D1 and D2 two sub branches. 10 CV-A6 sequences obtained in the Anyang area, 6 belonged to the D1 sub branch, 4 to the D2 sub branch.

【作者單位】： 安陽市疾病預(yù)防控制中心;河南省疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所;
【基金】：河南省科技攻關(guān)計(jì)劃項(xiàng)目(122102310268) 河南省醫(yī)學(xué)科技重大攻關(guān)項(xiàng)目(201001015) 河南省衛(wèi)生科技創(chuàng)新型人才工程中青年科技創(chuàng)新人才 河南省安陽市科技攻關(guān)項(xiàng)目(2013042)
【分類號】：R725.1
【正文快照】： 手足口病最早見于20世紀(jì)50年代末,它是由多種腸道病毒引起的出疹發(fā)熱性急性傳染病,主要侵害對象為低齡嬰幼兒。在引起手足口病的多種腸道病毒中,柯薩奇病毒A組16型(CV-A16)和腸道病毒71型(EV-A71)通常被認(rèn)為是最主要的病原體,其流行范圍較廣,常有暴發(fā)疫情出現(xiàn),危害程度較重。

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號：1419652