倭蜂猴細(xì)胞色素b基因和D-loop序列多態(tài)性分析
本文關(guān)鍵詞:倭蜂猴細(xì)胞色素b基因和D-loop序列多態(tài)性分析 出處:《生物學(xué)雜志》2016年06期 論文類型:期刊論文
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【摘要】:對云南大圍山保護區(qū)7例倭蜂猴線粒體DNA細(xì)胞色素b基因(Cytb)和控制區(qū)序列(D-loop)進(jìn)行了PCR擴增、序列測定、核苷酸組成和多態(tài)性分析。結(jié)果表明:Cytb中,A、T、C和G 4種核苷酸的比例分別為29.3%、28.2%、29.8%和12.7%,A+T含量為57.5%,G+C含量為42.5%。在長度為1078 bp的Cytb序列中,存在4個變異位點,核苷酸多樣性指數(shù)(π值)為0.00106,僅出現(xiàn)3種單倍型。7個倭蜂猴個體的遺傳距離為0.000~0.003。D-loop區(qū)序列中,A、T、C和G 4種核苷酸的比例分別為31.8%、29.1%、25.0%和14.1%,A+T含量為60.9%,G+C含量為39.1%。在381 bp長的D-loop區(qū)序列中,僅存在4個變異位點,核苷酸多樣性指數(shù)(π值)為0.003 00,僅出現(xiàn)4種單倍型。7個倭蜂猴個體的遺傳距離為0.000~0.008。研究表明倭蜂猴種內(nèi)個體間差異小,群體多態(tài)程度低。通過與其他物種相比,進(jìn)行遺傳多樣性分析,倭蜂猴遺傳多態(tài)性低,種群小,發(fā)生遺傳漂變強度大,因此,倭蜂猴在遺傳多樣性水平上是迫切需要保護的。
[Abstract]:The mitochondrial DNA cytochrome b gene (Cytb) and the control region (D-loop) were amplified by PCR and sequenced. The results of nucleotide composition and polymorphism analysis showed that the proportion of four kinds of nucleotides in the two groups were 29.328.2% and 12.7%, respectively. The content of A T was 57.5% and the content of G C was 42.5. There were four mutation sites in the Cytb sequence of 1078bp. The nucleotide diversity index (蟺 value) was 0.00106, only 3 haplotypes were found. The genetic distance of 7 individuals was 0.000 ~ 0.003.D-loop sequence. The ratios of C and G were 31.8and 29.1cm 25.0% and 14.1%, respectively, and the content of A T was 60.9%. In the 381bp D-loop region, there were only four mutation sites, and the nucleotide diversity index (蟺) was 0.003 00. There were only 4 haplotypes. The genetic distance of 7 individuals was 0.000 ~ 0.008. The results showed that there was little difference among individuals and low population polymorphism. Compared with other species, the genetic distance of 7 individuals was 0.000 ~ 0.008. In the analysis of genetic diversity, the genetic polymorphism of bonobos was low, the population was small, and the intensity of genetic drift was high. Therefore, it was urgent to protect the genetic diversity of bonobos in the level of genetic diversity.
【作者單位】: 云南省高校西南山地生態(tài)系統(tǒng)動植物生態(tài)適應(yīng)進(jìn)化及保護重點實驗室云南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;昆明市?诹謭;
【基金】:國家自然科學(xué)基金項目(No.31260097;31560126)
【分類號】:Q953
【正文快照】: 線粒體DNA(mitochondria DNA,mt DNA)是一類核外的遺傳物質(zhì),可獨立進(jìn)行復(fù)制與轉(zhuǎn)錄,相比與核DNA,它具有以下特點:母系遺傳、分子結(jié)構(gòu)相對簡單、進(jìn)化速度較快、堿基變異較大等等[1-2]。其通常用于動物遺傳變異的研究,在哺乳動物中已有許多報道[3-5]。mt DNA中的細(xì)胞色素b基因(cy
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,本文編號:1394512
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