本文關鍵詞：miR-335在腫瘤組織中的表達及其預測靶基因的生物信息學分析　出處：《中國生物工程雜志》2016年03期 　論文類型：期刊論文

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【摘要】：目的:分析miR-335在多種腫瘤組織與癌旁組織中的表達,預測其靶基因并進行相關生物信息學分析,為進一步研究miR-335在腫瘤中的調(diào)控機制提供理論基礎。方法:分析miR-335的保守性及在多個腫瘤組織中的表達;預測miR-335靶基因,并使用DAIVID對miR-335靶基因進行生物信息學分析。結果:miR-335序列高度保守,在肝癌、肺癌、乳腺癌、肝內(nèi)膽管癌、脂肪肉瘤中表達下調(diào)(P0.05)。預測miR-335靶基因共34個,靶基因集合功能富集于細胞遷移、凋亡、轉錄調(diào)控,以及蛋白質(zhì)分子連接、細胞骨架組成等生物學過程和分子功能(P0.05);主要參與了軸突向導和黏著斑信號通路、黑素瘤疾病信號通路及TGF-β信號通路(P0.05)。結論:miR-335在多種腫瘤中表達異常,且涉及多個生物學過程和信號轉導通路,與腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關。
[Abstract]:Objective: to analyze the expression of miR-335 in various tumor tissues and adjacent tissues, to predict the target genes and to analyze the related bioinformatics. Methods: the conserved nature of miR-335 and its expression in multiple tumor tissues were analyzed. MiR-335 target gene was predicted and bioinformatics analysis of miR-335 target gene was carried out using DAIVID. Results the sequence of miR-335 target gene was highly conserved in liver cancer and lung cancer. In breast cancer, intrahepatic cholangiocarcinoma and liposarcoma, the expression of P0.05 was down-regulated. 34 miR-335 target genes were predicted, and the function of target genes was concentrated in cell migration, apoptosis and transcriptional regulation. The biological processes and molecular functions such as protein molecular connection, cytoskeleton composition, etc. It is mainly involved in axon guide, adhesion plaque signal pathway, melanoma disease signal pathway and TGF- 尾 signal pathway P0.05.Conclusion the expression of 1% miR-335 is abnormal in many kinds of tumors. It involves many biological processes and signal transduction pathways, and is closely related to tumorigenesis and development.
【作者單位】： 南方醫(yī)科大學基因工程研究所;
【基金】：國家自然科學基金(39880032) 廣東省領軍人才基金(C1030925)資助項目
【分類號】：Q78;R730.2
【正文快照】： miRNA是含有約22個堿基的單鏈非編碼RNA,可以結合mRNA的3'非編碼區(qū)(3'UTR)從而調(diào)節(jié)其轉錄水平或降解該mRNA[1]。miRNA表達譜芯片分析是高通量評估特定腫瘤樣本miRNA表達水平的最常用技術,海量的腫瘤組織及細胞系miRNA表達譜芯片數(shù)據(jù)表明,miRNA的異常表達對腫瘤細胞功能影響強

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本文編號：1390373