大鯢補體C1q及其補體信號通路相關基因的生物信息學分析
發(fā)布時間:2018-01-05 17:41
本文關鍵詞:大鯢補體C1q及其補體信號通路相關基因的生物信息學分析 出處:《生物技術(shù)》2016年01期 論文類型:期刊論文
【摘要】:[目的]對大鯢補體C1q及其補體信號通路相關基因進行生物信息學分析。[方法]利用BLAST軟件從大鯢肝臟轉(zhuǎn)錄組中篩選獲得其補體C1q cDNA全長,并進行了序列比對、系統(tǒng)進化樹及3-D結(jié)構(gòu)分析。對大鯢補體信號通路相關基因進行搜索并構(gòu)建信號傳導通路。[結(jié)果]大鯢補體C1q cDNA全長為990 bp,編碼246個氨基酸。大鯢補體C1q與其他物種C1q的序列相似性為32.9%~73.4%。一系列補體系統(tǒng)相關基因在大鯢中被發(fā)現(xiàn),包括補體C1r、C1s、C2、C3、C4、C7、C8、C9以及補體調(diào)節(jié)蛋白等。[結(jié)論]獲得了大鯢補體C1q cDNA序列及其信號傳導通路基因(C1r、C1s、C2、C3、C4、C7、C8、C9)及調(diào)節(jié)蛋白,為深入研究兩棲類乃至低等脊椎動物的補體系統(tǒng)功能奠定了基礎。
[Abstract]:The cDNA sequence of complement C1q cDNA and its signal transduction pathway genes ( C1r , C1s , C2 , C3 , C4 , C7 , C8 , C9 ) and regulatory proteins were obtained .
【作者單位】: 江蘇省海洋灘涂生物化學與生物技術(shù)重點建設實驗室鹽城工學院;江蘇省沿海池塘養(yǎng)殖生態(tài)重點實驗室鹽城工學院;
【基金】:國家自然科學基金項目(“大鯢肽聚糖識別蛋白家族及其抗菌免疫功能研究”,No.31302221)資助
【分類號】:S917.4;Q811.4
【正文快照】: 補體系統(tǒng)是機體固有免疫反應的重要組成部分,在機體抵御病原微生物過程中發(fā)揮不可替代的作用,并在固有性免疫反應與獲得性免疫反應之間起到橋梁作用[1]。補體系統(tǒng)由30多個可溶性蛋白及膜結(jié)合蛋白構(gòu)成,這些蛋白質(zhì)通過相互作用進而形成補體級聯(lián)反應[2]。補體系統(tǒng)的經(jīng)典激活途徑
【參考文獻】
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【共引文獻】
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7 于U,
本文編號:1384181
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