水稻OsUVR8基因電子克隆及生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2017-12-29 14:09
本文關(guān)鍵詞:水稻OsUVR8基因電子克隆及生物信息學(xué)分析 出處:《生物技術(shù)》2016年02期 論文類型:期刊論文
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【摘要】:[目的]獲得水稻Os UVR8基因的編碼區(qū)序列,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。[方法]以擬南芥UVR8蛋白的氨基酸序列作為查詢探針,用電子克隆的方法獲得Os UVR8基因的編碼區(qū)序列;用生物信息學(xué)軟件對(duì)Os UVR8蛋白進(jìn)行預(yù)測(cè)和分析。[結(jié)果]Os UVR8基因有13個(gè)外顯子,編碼區(qū)序列長(zhǎng)1 764 bp,編碼587個(gè)氨基酸。Os UVR8蛋白分子量為62132.7 Da,理論等電點(diǎn)為5.87,含有41個(gè)芳香族氨基酸,比較穩(wěn)定,為親水性蛋白。無(wú)規(guī)則卷曲是主要的二級(jí)結(jié)構(gòu),其次是延伸鏈。位于細(xì)胞內(nèi)葉綠體、線粒體之外的區(qū)域。具有9個(gè)RCC1重復(fù)。有35個(gè)磷酸化位點(diǎn),19個(gè)O-β-葡萄糖糖基化位點(diǎn),6個(gè)Yin-Yang位點(diǎn)。三級(jí)結(jié)構(gòu)與擬南芥UVR8蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)相似。[結(jié)論]獲得了水稻Os UVR8基因的編碼區(qū)序列并進(jìn)行了生物信息學(xué)分析。
[Abstract]:......
【作者單位】: 湖北科技學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院;
【分類號(hào)】:Q943.2
【正文快照】: 紫外線作為植物生長(zhǎng)必需的太陽(yáng)光的組成部分,也影響著植物的生長(zhǎng)、發(fā)育和代謝。紫外線B對(duì)植物具有明顯的雙重效應(yīng),即高強(qiáng)度的UV-B輻射對(duì)于植物是一種環(huán)境脅迫因子,可引起細(xì)胞內(nèi)蛋白和DNA的損傷,抑制植物生長(zhǎng);而低強(qiáng)度的UV-B輻射對(duì)于植物卻是信號(hào)調(diào)控因子[1]。植物通過(guò)UV-B光受
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本文編號(hào):1350575
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