本文關(guān)鍵詞：毛白楊不同組織器官穩(wěn)定表達(dá)看家基因的篩選　出處：《植物生理學(xué)報》2016年08期 　論文類型：期刊論文

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【摘要】：以毛白楊(Populus tomentosa)‘BJHR01’的不同組織器官為材料,運用實時熒光定量PCR(qRT-PCR)技術(shù)及內(nèi)參基因表達(dá)穩(wěn)定性分析軟件Best Keeper、Norm Finder和geNorm分析了8個看家基因在毛白楊不同組織器官中的表達(dá)穩(wěn)定性。所選看家基因包括細(xì)胞骨架蛋白肌動蛋白基因(actin)、微管蛋白基因(TUB)、18S核糖體RNA基因(18S rRNA)、翻譯延伸因子(EF-1 beta)、翻譯起始因子(eIF 5AV)、組蛋白編碼基因(H3)、核糖體蛋白基因(RP)和泛素蛋白基因(UBQ),結(jié)果發(fā)現(xiàn)eIF 5AV、actin和UBQ三個內(nèi)參基因在毛白楊不同組織器官中表達(dá)水平穩(wěn)定,適合在定量PCR分析中作為內(nèi)參基因;TUB的表達(dá)穩(wěn)定性最差,不適宜作為毛白楊不同組織器官基因表達(dá)研究的內(nèi)參基因。在毛白楊不同組織器官基因表達(dá)水平研究中,可選用eIF 5AV、actin和UBQ三個內(nèi)參基因的幾何平均數(shù)作為參照標(biāo)準(zhǔn),實驗數(shù)據(jù)的分析將更為準(zhǔn)確。
[Abstract]:In poplar (Populus tomentosa) "BJHR01" in different organs as materials, using real-time fluorescence quantitative PCR (qRT-PCR) Keeper, Norm stability analysis software Best Finder and geNorm 8 housekeeping genes in different organs of poplar tissue expression stability analysis and reference gene expression technology. The selected housekeeping genes including cytoskeletal protein actin gene (actin), tubulin gene (TUB), 18S (18S rRNA) ribosomal RNA gene, translation elongation factor (EF-1 beta), translation initiation factor (eIF 5AV), group of protein encoding gene (H3), ribosomal protein gene (RP) and the ubiquitin gene (UBQ), the expression level of 5AV, actin and UBQ eIF three reference genes in Poplar in different organs, suitable as a reference gene in quantitative PCR analysis; stability of the expression of TUB was the worst, not suitable for Poplar organ gene in different tissues of reference gene expression. In different organs of poplar gene expression study, the geometric mean can be used eIF 5AV, actin and UBQ of the three reference genes as reference standard, the analysis of the experimental data will be more accurate.
【作者單位】： 北京市農(nóng)林科學(xué)院北京農(nóng)業(yè)生物技術(shù)研究中心;首都師范大學(xué);
【基金】：國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(“863”計劃)項目(2013AA-102702) 國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(“973”計劃)項目(2012CB114501)~~
【分類號】：S792.117
【正文快照】： 收稿2016-06-29修定2016-07-18資助國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(“863”計劃)項目(2013AA-102702)和國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(“973”計劃)項目(2012CB114501)。林木是最主要的可再生資源,具有重要的經(jīng)濟(jì)價值。當(dāng)前,隨著毛果楊(Populus trichocarpa)、巨桉(Eucalyptus grandis)等

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本文編號：1343027