本文關(guān)鍵詞：人CITED4基因及蛋白的生物信息學(xué)分析　出處：《生物技術(shù)》2016年06期 　論文類型：期刊論文

  更多相關(guān)文章： CITED AP- 基因轉(zhuǎn)錄 生物信息學(xué)

【摘要】：[目的]預(yù)測人CITED4基因啟動子信息及其蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)、親疏水性、細胞亞定位、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、相互作用蛋白質(zhì)以及GO注釋,以期為發(fā)現(xiàn)其新功能提供理論和結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。[方法]利用Promoter Scan、Prot Param和Clustal X2.1等預(yù)測分析CITED4基因及其蛋白的相關(guān)信息。[結(jié)果]CITED4基因有2個啟動子,其轉(zhuǎn)錄活性受SP1、AP-2和CREB影響;其蛋白質(zhì)是由184個氨基酸組成的主要定位于細胞核的不穩(wěn)定疏水蛋白質(zhì),不穩(wěn)定系數(shù)為65.05;氨基酸序列在152~173間保守性強;二級結(jié)構(gòu)含有47個α螺旋16個β折疊;三級結(jié)構(gòu)的建立需要更多可靠的模板,CITED4通過與AP-2等轉(zhuǎn)錄因子相互作用調(diào)控多個基因的轉(zhuǎn)錄活性。[結(jié)論]CITED4表達受SP1、AP-2和CREB的調(diào)控,CITED4蛋白通過調(diào)節(jié)多個靶基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控人體正常生理或病理狀態(tài)。
[Abstract]:[Objective] to predict human CITED4 gene promoter information and protein physicochemical properties, hydrophobicity, cell Sublocation, protein structure, interacting proteins and GO annotations, in order to provide theoretical and structural basis for finding new functions. [Methods] the Promoter Scan, Prot Param and Clustal X2.1 were used to predict the related information of the CITED4 gene and its protein. The]CITED4 gene 2 promoter and its transcriptional activity by SP1, AP-2 and CREB; the protein is not stable hydrophobic protein composed of 184 amino acids was mainly localized in the nucleus, the instability coefficient is 65.05; the amino acid sequence between 152~173 conservative strong; the two stage structure containing 47 alpha helix 16 beta folding; establishment of three level structure needs more reliable template, transcriptional regulation by CITED4 and AP-2 transcription factor interactions of multiple genes. [conclusion the expression of]CITED4 is regulated by SP1, AP-2 and CREB, and the CITED4 protein regulates the normal physiological or pathological state of the human body by regulating the transcription of multiple target genes.
【作者單位】： 天津醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院國家腫瘤臨床醫(yī)學(xué)研究中心天津市腫瘤防治重點實驗室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(“mTOR調(diào)控P62降解在膠質(zhì)瘤自噬中的作用及其機制研究”,No.81602213)
【分類號】：Q811.4
【正文快照】： CITED4(CREB結(jié)合蛋白/具有富含ED尾端的P300蛋白相互作用反式激活物,成員4)是CITED家族的一員,參與包括TGFβ(轉(zhuǎn)化生長因子β)、ER(雌激素受體)、TFAP2(人類同種型相互作用轉(zhuǎn)錄因子AP2)和HIF1α(缺氧誘導(dǎo)因子1)等基因的活性調(diào)節(jié)。CITED1(msg1)、CITED2(mrg1,p35srg)和CITED4(m

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