本文關(guān)鍵詞：青楊4CL基因的克隆及生物信息學(xué)分析　出處：《西南農(nóng)業(yè)學(xué)報》2016年07期 　論文類型：期刊論文

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【摘要】：4CL是木質(zhì)素合成途徑中的關(guān)鍵酶,對其進(jìn)行生物信息學(xué)分析,為深入研究4CL的作用奠定基礎(chǔ)并為進(jìn)一步改良青楊提供理論支撐。以青楊嫩莖為試材,采用RT-PCR方法克隆青楊4CL基因,使用NCBI、DNAMAN及Ex PASy等一系列在線軟件及工具,對青楊4CL基因的編碼區(qū)、氨基酸序列及蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行生物信息學(xué)分析�？寺×饲鄺�4CL基因,命名為Pc4CL(Gen Bank注冊號:KJ490636)。該基因全長1623 bp,開放閱讀框為1~1611 bp,編碼536個氨基酸,含有4CL的保守域SSGTTGLPKGV和GEICIRG及催化活性殘基His-234。Pc4CL與Pt C4CL同源性最高達(dá)97.95%。
【作者單位】： 西南科技大學(xué)植物細(xì)胞工程實驗室;四川省生物質(zhì)資源利用與改性工程技術(shù)研究中心;
【基金】：國家自然科學(xué)基金青年基金項目(31400257,31400333) 四川省“十二五”重點公關(guān)資助項目(2011YZGG-10) 四川省應(yīng)用基礎(chǔ)研究基金資助項目(2013JY0182) 四川省生物質(zhì)資源利用與改性工程技術(shù)研究中心基金資助(12zxsk07,13zxsk01)
【分類號】：S792.113
【正文快照】： 4-香豆酸:輔酶A連接酶(4-coumarate:coen-zyme A ligase,4CL,EC6.2.1.12)是苯丙烷類代謝途徑的最后一個酶,能以不同結(jié)構(gòu)的羥基苯乙烯酸為底物,即4CL同工酶可能控制不同分支途徑的碳流量,進(jìn)而形成不同的木質(zhì)素單體(松柏醇、芥子醇和香豆醇)[1-2]。木質(zhì)素是植物體正常生長所必須

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本文編號：1334082