本文關(guān)鍵詞：陽(yáng)春砂基于轉(zhuǎn)錄組的萜類(lèi)合酶基因挖掘及一個(gè)單萜合酶基因的克隆　出處：《廣州中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào)》2016年03期 　論文類(lèi)型：期刊論文

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【摘要】：【目的】深入挖掘陽(yáng)春砂轉(zhuǎn)錄組中揮發(fā)性萜類(lèi)合酶相關(guān)基因,為全面認(rèn)識(shí)陽(yáng)春砂揮發(fā)性萜類(lèi)代謝途徑和分子調(diào)控模式奠定基礎(chǔ)。【方法】整理前期工作獲得的陽(yáng)春砂2個(gè)轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù),篩選已注釋的及利用本地blast方法再注釋的萜類(lèi)合成途徑的unigene;并通過(guò)對(duì)部分候選unigene的表達(dá)量與揮發(fā)性萜類(lèi)化合物含量的相關(guān)性分析及生物信息學(xué)分析,進(jìn)一步篩選出相關(guān)基因;采用PCR及重組載體構(gòu)建的方法克隆其中一個(gè)單萜合酶基因,并對(duì)其編碼蛋白序列進(jìn)行分析。【結(jié)果】篩選得到10個(gè)揮發(fā)性萜類(lèi)合成上游途徑相關(guān)unigene及11個(gè)下游萜類(lèi)合酶基因;相關(guān)性分析證明候選基因與陽(yáng)春砂主要揮發(fā)性萜類(lèi)有較強(qiáng)相關(guān)性;并成功克隆得到Av TPS1基因,其序列包含1 803 bp的開(kāi)放閱讀框,編碼600個(gè)氨基酸;其編碼蛋白含有單萜合酶蛋白特有的DDXXD、RRX8W和NSE/DTE等保守基序,N端含有一段葉綠體轉(zhuǎn)運(yùn)肽;系統(tǒng)進(jìn)化分析表明Av TPS1屬于TPS-b亞家族�！窘Y(jié)論】結(jié)合轉(zhuǎn)錄組、表達(dá)譜數(shù)據(jù)的深入挖掘和與揮發(fā)性萜類(lèi)化合物數(shù)據(jù)的關(guān)聯(lián),有效篩選出了陽(yáng)春砂多個(gè)值得后續(xù)研究的萜類(lèi)合酶基因;其中對(duì)Av TPS1的克隆及生物信息學(xué)分析為后續(xù)功能鑒定提供了基礎(chǔ)。
【作者單位】： 廣州中醫(yī)藥大學(xué)中藥資源科學(xué)與工程研究中心嶺南中藥資源教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室國(guó)家中成藥工程技術(shù)研究中心南藥研發(fā)實(shí)驗(yàn)室;廣州中醫(yī)藥大學(xué)中藥學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金青年科學(xué)基金項(xiàng)目(編號(hào):81303163) 廣東省高等學(xué)校優(yōu)秀青年教師培養(yǎng)計(jì)劃項(xiàng)目(編號(hào):Yq2013042) 廣州中醫(yī)藥大學(xué)青年英才培養(yǎng)項(xiàng)目(編號(hào):AAC414124A08)
【分類(lèi)號(hào)】：R284.1
【正文快照】： 砂仁是芳香化濕類(lèi)中藥,也是我國(guó)“四大南藥”之一,其性溫,味辛,具有化濕開(kāi)胃、溫脾止瀉、理氣安胎等功效[1]。陽(yáng)春砂Amomum villosumLour.是砂仁的主流品種,廣東陽(yáng)春所產(chǎn)的道地藥材陽(yáng)春砂品質(zhì)最佳[2-3]。揮發(fā)油是陽(yáng)春砂芳香化濕、行氣止痛的主要物質(zhì)基礎(chǔ)。道地藥材陽(yáng)春砂果實(shí)

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1 馬泉芳;單萜合酶AtTPS03基因在湘油15中的過(guò)表達(dá)研究[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

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本文編號(hào)：1333156