腎腫瘤相關基因的共表達網(wǎng)絡構建與分析
發(fā)布時間:2017-12-18 21:59
本文關鍵詞:腎腫瘤相關基因的共表達網(wǎng)絡構建與分析
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【摘要】:作為泌尿系統(tǒng)常見的腫瘤之一,腎腫瘤發(fā)病率在逐年上升。針對Affymetrix hgu133b的基因芯片數(shù)據(jù)進行差異表達基因篩選,應用加權基因共表達網(wǎng)絡分析算法構建腎腫瘤差異表達基因的共表達網(wǎng)絡。分析腎部正常組織和腫瘤組織差異表達基因之間的關聯(lián)模式;選取與腫瘤發(fā)生關聯(lián)程度最高的模塊,篩選樞紐基因。最后,針對樞紐基因進行基因本體富集分析。細胞衰老是抑制腫瘤發(fā)生的主要機制之一,分析結(jié)果顯示樞紐基因PLA2R1和TBX3與細胞衰老有關,可能對腎腫瘤的形成具有重要影響。該結(jié)果與基因PLA2R1通過促進細胞衰老抑制腎部腫瘤發(fā)生的研究結(jié)論一致。
【作者單位】: 內(nèi)蒙古科技大學數(shù)理與生物工程學院;
【基金】:國家自然科學基金面上項目(61271448;11547150) 內(nèi)蒙古自然科學基金面上項目(2014MS0311;2014MS0312)資助項目
【分類號】:R737.11
【正文快照】: 腎腫瘤是泌尿系統(tǒng)常見的腫瘤之一,近年來的發(fā)病率趨勢呈明顯上升,成為威脅人類健康的最重要腫瘤之一[1],在我國,腎部惡性腫瘤已經(jīng)占到成人惡性腫瘤的2%~3%。腫瘤致病機理涉及多個基因間的相互作用,因此,僅關注單個或某幾個基因的研究方法已經(jīng)不能滿足當前的研究需要。近年來,
【相似文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 周成貴;姚晨;李紅東;郭政;;前列腺癌多階段相關樞紐蛋白的差異共表達模式[J];生物信息學;2011年01期
中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 周成貴;前列腺癌多階段相關樞紐蛋白的差異共表達模式[D];電子科技大學;2010年
,本文編號:1305747
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