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腎腫瘤相關(guān)基因的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與分析

發(fā)布時(shí)間:2017-12-18 21:59

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【摘要】:作為泌尿系統(tǒng)常見的腫瘤之一,腎腫瘤發(fā)病率在逐年上升。針對(duì)Affymetrix hgu133b的基因芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行差異表達(dá)基因篩選,應(yīng)用加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析算法構(gòu)建腎腫瘤差異表達(dá)基因的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)。分析腎部正常組織和腫瘤組織差異表達(dá)基因之間的關(guān)聯(lián)模式;選取與腫瘤發(fā)生關(guān)聯(lián)程度最高的模塊,篩選樞紐基因。最后,針對(duì)樞紐基因進(jìn)行基因本體富集分析。細(xì)胞衰老是抑制腫瘤發(fā)生的主要機(jī)制之一,分析結(jié)果顯示樞紐基因PLA2R1和TBX3與細(xì)胞衰老有關(guān),可能對(duì)腎腫瘤的形成具有重要影響。該結(jié)果與基因PLA2R1通過促進(jìn)細(xì)胞衰老抑制腎部腫瘤發(fā)生的研究結(jié)論一致。
【作者單位】: 內(nèi)蒙古科技大學(xué)數(shù)理與生物工程學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(61271448;11547150) 內(nèi)蒙古自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(2014MS0311;2014MS0312)資助項(xiàng)目
【分類號(hào)】:R737.11
【正文快照】: 腎腫瘤是泌尿系統(tǒng)常見的腫瘤之一,近年來的發(fā)病率趨勢(shì)呈明顯上升,成為威脅人類健康的最重要腫瘤之一[1],在我國,腎部惡性腫瘤已經(jīng)占到成人惡性腫瘤的2%~3%。腫瘤致病機(jī)理涉及多個(gè)基因間的相互作用,因此,僅關(guān)注單個(gè)或某幾個(gè)基因的研究方法已經(jīng)不能滿足當(dāng)前的研究需要。近年來,

【相似文獻(xiàn)】

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1 周成貴;姚晨;李紅東;郭政;;前列腺癌多階段相關(guān)樞紐蛋白的差異共表達(dá)模式[J];生物信息學(xué);2011年01期

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1 周成貴;前列腺癌多階段相關(guān)樞紐蛋白的差異共表達(dá)模式[D];電子科技大學(xué);2010年

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本文編號(hào):1305747

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