基于表達(dá)譜芯片挖掘清遠(yuǎn)麻雞和科寶肉雞比目魚肌差異表達(dá)基因
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【摘要】:對(duì)生長(zhǎng)速度長(zhǎng)期的高壓選擇導(dǎo)致了快大型肉雞與優(yōu)質(zhì)型地方雞顯著的表型差異,本研究旨在研究這種表型差異的分子遺傳機(jī)理。采用Agilent雞全基因組表達(dá)譜芯片對(duì)達(dá)到性成熟的優(yōu)質(zhì)型清遠(yuǎn)麻雞(112d)和快大型科寶肉雞(42d)比目魚肌中與肌纖維發(fā)育和類型組成相關(guān)的候選基因及信號(hào)通路進(jìn)行系統(tǒng)篩查。結(jié)果,芯片分析共篩選到差異倍數(shù)在2倍及以上的基因1 318個(gè),以科寶肉雞作為參照,清遠(yuǎn)麻雞中上調(diào)基因501個(gè),下調(diào)基因817個(gè),主要涉及到肌肉發(fā)育、能量代謝、脂質(zhì)代謝等生物學(xué)過程;贙EGG Pathway分析發(fā)現(xiàn),差異基因除了參與肌纖維發(fā)育和分化相關(guān)信號(hào)通路(如Hedgehog信號(hào)通路和Ca2+信號(hào)通路)外,Wnt信號(hào)通路,mTOR信號(hào)通路,MAPK信號(hào)通路,ErbB信號(hào)通路、JAK-STAT信號(hào)通路等一些跟能量代謝相關(guān)的信號(hào)通路也被富集為顯著的信號(hào)通路。與能量代謝相關(guān)的信號(hào)通路和與肌肉發(fā)育相關(guān)的信號(hào)通路相互作用形成一個(gè)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)從而影響肌纖維的發(fā)育,篩選出了20個(gè)在肌纖維生長(zhǎng)發(fā)育及分化過程中可能具有重要影響的候選基因,但這些差異表達(dá)基因在肌纖維的發(fā)育和分化過程中的作用尚待深入研究。
【作者單位】: 江蘇省家禽科學(xué)研究所;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(31301967) 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)資金(CARS-42-G03) 江蘇省自然科學(xué)基金(BK2012268) 江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新資金項(xiàng)目(cx(15)1009)
【分類號(hào)】:S831
【正文快照】: 隨著人們生活水平的不斷提高和消費(fèi)觀念的轉(zhuǎn)變,肉品質(zhì)愈來愈受到人們的重視。我國(guó)是一個(gè)禽類品種資源十分豐富的國(guó)家,各地方雞種多以肉質(zhì)鮮美而著稱,尤其是廣東的清遠(yuǎn)麻雞,素以皮色金黃、肉質(zhì)嫩滑、皮脆爽、骨軟、風(fēng)味獨(dú)特而馳名于粵港澳市場(chǎng)。本課題組前期研究發(fā)現(xiàn),相較于快
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1295435
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