基于表達譜芯片挖掘清遠麻雞和科寶肉雞比目魚肌差異表達基因
本文關鍵詞:基于表達譜芯片挖掘清遠麻雞和科寶肉雞比目魚肌差異表達基因
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【摘要】:對生長速度長期的高壓選擇導致了快大型肉雞與優(yōu)質型地方雞顯著的表型差異,本研究旨在研究這種表型差異的分子遺傳機理。采用Agilent雞全基因組表達譜芯片對達到性成熟的優(yōu)質型清遠麻雞(112d)和快大型科寶肉雞(42d)比目魚肌中與肌纖維發(fā)育和類型組成相關的候選基因及信號通路進行系統(tǒng)篩查。結果,芯片分析共篩選到差異倍數(shù)在2倍及以上的基因1 318個,以科寶肉雞作為參照,清遠麻雞中上調基因501個,下調基因817個,主要涉及到肌肉發(fā)育、能量代謝、脂質代謝等生物學過程。基于KEGG Pathway分析發(fā)現(xiàn),差異基因除了參與肌纖維發(fā)育和分化相關信號通路(如Hedgehog信號通路和Ca2+信號通路)外,Wnt信號通路,mTOR信號通路,MAPK信號通路,ErbB信號通路、JAK-STAT信號通路等一些跟能量代謝相關的信號通路也被富集為顯著的信號通路。與能量代謝相關的信號通路和與肌肉發(fā)育相關的信號通路相互作用形成一個調控網(wǎng)絡從而影響肌纖維的發(fā)育,篩選出了20個在肌纖維生長發(fā)育及分化過程中可能具有重要影響的候選基因,但這些差異表達基因在肌纖維的發(fā)育和分化過程中的作用尚待深入研究。
【作者單位】: 江蘇省家禽科學研究所;
【基金】:國家自然科學基金(31301967) 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術體系建設專項資金(CARS-42-G03) 江蘇省自然科學基金(BK2012268) 江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新資金項目(cx(15)1009)
【分類號】:S831
【正文快照】: 隨著人們生活水平的不斷提高和消費觀念的轉變,肉品質愈來愈受到人們的重視。我國是一個禽類品種資源十分豐富的國家,各地方雞種多以肉質鮮美而著稱,尤其是廣東的清遠麻雞,素以皮色金黃、肉質嫩滑、皮脆爽、骨軟、風味獨特而馳名于粵港澳市場。本課題組前期研究發(fā)現(xiàn),相較于快
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,本文編號:1295435
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