本文關(guān)鍵詞：短絲木犀轉(zhuǎn)錄組測序及類胡蘿卜素生物合成相關(guān)基因表達分析

  更多相關(guān)文章： 短絲木犀 香花樹種 轉(zhuǎn)錄組測序 單基因簇 差異表達基因 實時熒光定量PCR

【摘要】：短絲木犀(Osmanthus serrulatus)是我國特有的木犀屬香花樹種,具有極高的開發(fā)應(yīng)用前景。筆者以短絲木犀為研究材料,應(yīng)用Illumina HISeqTM2000高通量測序平臺,對短絲木犀的花和葉芽進行轉(zhuǎn)錄組深度測序和拼接組裝,構(gòu)建和預測了短絲木犀不同組織間的基因表達譜及其代謝通路。轉(zhuǎn)錄組測序共獲得16.94 G的有效數(shù)據(jù),經(jīng)Trinity從頭組裝得到92 798條單基因簇(unigenes),其中35 851條unigenes與Nr、Nt、Pfam、KOG、Swiss-Prot、KEGG、PFAM等7大公共數(shù)據(jù)庫比對獲得了基因功能注釋信息。由KEGG代謝通路分析發(fā)現(xiàn),共有8 779條unigenes參與到262個代謝通路中,其中參與到色素和香味代謝的基因分別有53條和335條。此外,針對6條在短絲木犀花和葉芽間顯著差異表達的參與類胡蘿卜素生物合成的相關(guān)基因,通過實時熒光定量PCR,驗證了它們在不同組織間的表達模式。
【作者單位】： 南方現(xiàn)代林業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心南京林業(yè)大學生物與環(huán)境學院;南京農(nóng)業(yè)大學農(nóng)業(yè)生物學虛擬仿真實驗教學中心;
【基金】：國家自然科學基金項目(31300558) 江蘇省基礎(chǔ)研究計劃項目(BK20130972) 江蘇高校優(yōu)勢學科建設(shè)工程資助項目(PAPD) 南京林業(yè)大學高學歷人才基金項目(GXL201308)
【分類號】：S685.99
【正文快照】： 我國是世界木犀屬(Osmanthus)分布中心,全世界該屬植物共有35種,中國分布有26種[1]。近年來有關(guān)木犀屬植物在系統(tǒng)分類學、地理分布、化學成分、生理特性、栽培管理和分子生物學等領(lǐng)域的研究日趨廣泛和深入,但是大多數(shù)集中于桂花(Osmanthus fragrans)等植物,對于該屬其他植物的，

本文編號：1293634