本文關(guān)鍵詞：短絲木犀轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及類胡蘿卜素生物合成相關(guān)基因表達(dá)分析

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【摘要】：短絲木犀(Osmanthus serrulatus)是我國(guó)特有的木犀屬香花樹種,具有極高的開發(fā)應(yīng)用前景。筆者以短絲木犀為研究材料,應(yīng)用Illumina HISeqTM2000高通量測(cè)序平臺(tái),對(duì)短絲木犀的花和葉芽進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組深度測(cè)序和拼接組裝,構(gòu)建和預(yù)測(cè)了短絲木犀不同組織間的基因表達(dá)譜及其代謝通路。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序共獲得16.94 G的有效數(shù)據(jù),經(jīng)Trinity從頭組裝得到92 798條單基因簇(unigenes),其中35 851條unigenes與Nr、Nt、Pfam、KOG、Swiss-Prot、KEGG、PFAM等7大公共數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)獲得了基因功能注釋信息。由KEGG代謝通路分析發(fā)現(xiàn),共有8 779條unigenes參與到262個(gè)代謝通路中,其中參與到色素和香味代謝的基因分別有53條和335條。此外,針對(duì)6條在短絲木犀花和葉芽間顯著差異表達(dá)的參與類胡蘿卜素生物合成的相關(guān)基因,通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR,驗(yàn)證了它們?cè)诓煌M織間的表達(dá)模式。
【作者單位】： 南方現(xiàn)代林業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心南京林業(yè)大學(xué)生物與環(huán)境學(xué)院;南京農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)生物學(xué)虛擬仿真實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31300558) 江蘇省基礎(chǔ)研究計(jì)劃項(xiàng)目(BK20130972) 江蘇高校優(yōu)勢(shì)學(xué)科建設(shè)工程資助項(xiàng)目(PAPD) 南京林業(yè)大學(xué)高學(xué)歷人才基金項(xiàng)目(GXL201308)
【分類號(hào)】：S685.99
【正文快照】： 我國(guó)是世界木犀屬(Osmanthus)分布中心,全世界該屬植物共有35種,中國(guó)分布有26種[1]。近年來(lái)有關(guān)木犀屬植物在系統(tǒng)分類學(xué)、地理分布、化學(xué)成分、生理特性、栽培管理和分子生物學(xué)等領(lǐng)域的研究日趨廣泛和深入,但是大多數(shù)集中于桂花(Osmanthus fragrans)等植物,對(duì)于該屬其他植物的，

本文編號(hào)：1293634