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哈氏仿對蝦線粒體16S rRNA和COⅠ基因的序列比較及其與仿對蝦屬之間的系統(tǒng)進(jìn)化分析

發(fā)布時間:2017-12-15 02:11

  本文關(guān)鍵詞:哈氏仿對蝦線粒體16S rRNA和COⅠ基因的序列比較及其與仿對蝦屬之間的系統(tǒng)進(jìn)化分析


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【摘要】:為調(diào)查研究哈氏仿對蝦浙江象山群體的種質(zhì)資源、物種間的親緣關(guān)系及遺傳多樣性狀況,采用PCR擴(kuò)增獲得哈氏仿對蝦線粒體DNA的16S rRNA和COⅠ基因片段,分別對其進(jìn)行序列比較和系統(tǒng)進(jìn)化分析。16S r RNA基因片段的T、C、A和G的含量分別是35.76%、19.48%、26.74%和17.88%;COⅠ基因片段的T、C、A和G的含量分別是35.36%、12.68%、30.54%和21.43%;A+T含量顯著高于G+C含量。16S rRNA基因片段長度為558 bp,共檢測出1種單倍型,沒有多態(tài)性位點;COⅠ基因片段長度為688 bp,共檢測出7種單倍型,6個多態(tài)性位點。COⅠ基因片段比16S r RNA基因片段變異豐富,更適于哈氏仿對蝦種群的遺傳多樣性分析;16S rRNA和COⅠ基因片段的系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果不太一致,結(jié)合形態(tài)學(xué)分析表明,哈氏仿對蝦是仿對蝦屬獨立的分支,與細(xì)巧仿對蝦和亨氏仿對蝦種類親緣關(guān)系較近。根據(jù)COⅠ基因片段的遺傳距離推測出仿對蝦屬的大致分化時間發(fā)生在中新世末期至上新世早期。
【作者單位】: 上海海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命學(xué)院;中國水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所農(nóng)業(yè)部海洋漁業(yè)可持續(xù)發(fā)展重點實驗室;中國水產(chǎn)科學(xué)研究院南海水產(chǎn)研究所農(nóng)業(yè)部南海漁業(yè)資源開發(fā)利用重點實驗室;
【基金】:國家科技基礎(chǔ)條件平臺項目(2016DKA30470) 國家蝦產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系專項(CARS-47)~~
【分類號】:S917.4
【正文快照】:

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

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2 何賢保;俞存根;覃濤;鄭獻(xiàn)之;寧平;;舟山漁場及附近海域蝦類群落結(jié)構(gòu)特征分析[J];水生生物學(xué)報;2013年03期

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4 馬朋;劉萍;李健;李吉濤;高保全;;脊尾白蝦(Exopalaemon carinicauda)3個野生群體mtDNA 16S rRNA序列差異及長臂蝦科系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系[J];海洋與湖沼;2012年01期

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9 畢瀟瀟;高天翔;肖永雙;李永振;;4種鱈魚線粒體16S rRNA、COI和Cyt b基因片段序列的比較研究[J];南方水產(chǎn);2009年03期

10 宋海棠;俞存根;薛利建;;東海哈氏仿對蝦的數(shù)量分布和生長特性研究[J];水生生物學(xué)報;2009年01期

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 高俊娜;三疣梭子蟹和日本圀的線粒體DNA序列比較分析及三疣梭子蟹蛻皮抑制激素基因的SNP位點篩選[D];中國海洋大學(xué);2011年

2 徐琰;中國近海仿對蝦屬分子系統(tǒng)演化和近似種問題的研究[D];中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所);2005年

【共引文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 毛智超;段亞飛;劉萍;李健;陳萍;;哈氏仿對蝦線粒體16S rRNA和COⅠ基因的序列比較及其與仿對蝦屬之間的系統(tǒng)進(jìn)化分析[J];水產(chǎn)學(xué)報;2016年07期

2 王靜;紀(jì)維紅;徐長林;蘇軍虎;;達(dá)烏爾黃鼠線粒體Cyt b基因序列特征及其系統(tǒng)進(jìn)化分析[J];草原與草坪;2016年03期

3 夏陸軍;陳萬東;鄭基;蔡厚才;伍爾魏;畢耜瑤;謝旭;俞存根;;南麂列島海洋自然保護(hù)區(qū)的蝦類種類組成和數(shù)量分布[J];中國水產(chǎn)科學(xué);2016年03期

4 劉路;;分子生物學(xué)方法鑒定常見魚糜制品種源成分[J];生物技術(shù)世界;2016年04期

5 夏陸軍;俞存根;蔡厚才;鄭基;陳萬東;伍爾魏;畢耜瑤;謝旭;郭小雨;;南麂列島海洋自然保護(hù)區(qū)蝦類群落結(jié)構(gòu)及其多樣性[J];海洋學(xué)報;2016年02期

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7 徐捷;陳佳杰;徐兆禮;;呂泗漁場沿岸海域的蝦類數(shù)量分布及其與環(huán)境的關(guān)系[J];中國海洋大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2016年03期

8 馬微微;劉歡;趙文閣;劉鵬;;我國蜥蜴科動物線粒體基因組全序列的研究現(xiàn)狀[J];野生動物學(xué)報;2016年01期

9 趙子明;陳小江;杜迎春;黃堅淦;;五個湖泊中華刺鰍種群遺傳多樣性分析[J];水產(chǎn)科學(xué);2015年12期

10 陳夢義;徐梅;錢路;安榆林;郝德君;;DNA條形碼試劑盒檢測技術(shù)在墨天牛鑒定中的應(yīng)用[J];南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2015年06期

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 錢開誠;中國鴨綠江香魚的分類地位與遺傳多樣性研究[D];暨南大學(xué);2006年

【二級參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 劉帥;李墨非;葉嘉;王亞;王春琳;;基于線粒體16S rRNA和COI基因序列探討對蝦屬(Penaeus)物種系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系[J];生物學(xué)雜志;2012年05期

2 蔡恒輝;曹琛;魏國慶;郝詠芳;宋松偉;呂曉民;姜超;;干露、鹽度、溫度變化對中華虎頭蟹仔蟹的影響[J];水產(chǎn)科學(xué);2012年09期

3 宋娜;高天翔;王志勇;;中國近海路氏雙髻鯊群體線粒體DNA控制區(qū)序列比較分析[J];水產(chǎn)學(xué)報;2012年08期

4 李遠(yuǎn)寧;馬朋;劉萍;李琪;;三疣梭子蟹(Portunustri tuberculatus)4個野生群體ITS1序列分析及系統(tǒng)進(jìn)化分析[J];海洋與湖沼;2012年04期

5 王紅偉;原振政;祁峰;劉,

本文編號:1290223


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