發(fā)布時(shí)間：2017-12-14 15:27

  本文關(guān)鍵詞：基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)分析方法研究與應(yīng)用

  更多相關(guān)文章： 基因表達(dá)譜數(shù)據(jù) 基因聚類 BIRCH算法 趨勢(shì)匹配搜索算法 Gesture

【摘要】：通過(guò)生物信息學(xué)分析方法,對(duì)基因芯片技術(shù)產(chǎn)生的數(shù)萬(wàn)個(gè)基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行分析處理,可以揭示基因的功能和相互作用關(guān)系�；虮磉_(dá)譜數(shù)據(jù)的聚類分析是生物信息學(xué)領(lǐng)域中的研究熱點(diǎn),本文提出了基于BIRCH算法的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)的聚類分析方法,并針對(duì)應(yīng)用基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)時(shí),BIRCH算法中的平衡系數(shù)B、分支系數(shù)L及閾值T應(yīng)該如何選擇加以研究分析。從生物信息學(xué)研究者角度出發(fā),通過(guò)對(duì)生物信息學(xué)領(lǐng)域深入的分析研究,結(jié)合基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)研究的實(shí)際需求,發(fā)現(xiàn)聚類算法在處理基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)上有很多不足。因此,結(jié)合從局部到整體的研究方法,提出了一種趨勢(shì)匹配搜索算法,基于此算法可以搜索出表達(dá)相似或表達(dá)變化趨勢(shì)一致的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)。以上述理論為基礎(chǔ),應(yīng)用MATLAB語(yǔ)言開發(fā)了一種具有良好操作性的交互式圖形用戶界面軟件Gesture。運(yùn)用Gesture軟件,生物信息學(xué)研究者可以從熟悉的基因表達(dá)入手,或通過(guò)鼠標(biāo)繪制并擬合出所需要的基因表達(dá)模型,進(jìn)行挖掘并搜索出共表達(dá)或表達(dá)變化趨勢(shì)一致的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù),還可以搜索出抑制共表達(dá)和存在時(shí)延表達(dá)的基因譜數(shù)據(jù)。對(duì)搜索出的結(jié)果可以輸出并保存,依據(jù)這些相關(guān)的基因譜數(shù)據(jù)建立基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。Gesture軟件可以高效、實(shí)用的處理基因表達(dá)譜數(shù)據(jù),并且可以從大量的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)之中準(zhǔn)確、快速提取有意義的生物學(xué)信息。
【學(xué)位授予單位】：南京林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：Q811.4;TP311.13

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中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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本文編號(hào)：1288416