本文關鍵詞：基因表達譜數據分析方法研究與應用

  更多相關文章： 基因表達譜數據 基因聚類 BIRCH算法 趨勢匹配搜索算法 Gesture

【摘要】：通過生物信息學分析方法,對基因芯片技術產生的數萬個基因表達譜數據進行分析處理,可以揭示基因的功能和相互作用關系。基因表達譜數據的聚類分析是生物信息學領域中的研究熱點,本文提出了基于BIRCH算法的基因表達譜數據的聚類分析方法,并針對應用基因表達譜數據時,BIRCH算法中的平衡系數B、分支系數L及閾值T應該如何選擇加以研究分析。從生物信息學研究者角度出發(fā),通過對生物信息學領域深入的分析研究,結合基因表達譜數據研究的實際需求,發(fā)現聚類算法在處理基因表達譜數據上有很多不足。因此,結合從局部到整體的研究方法,提出了一種趨勢匹配搜索算法,基于此算法可以搜索出表達相似或表達變化趨勢一致的基因表達譜數據。以上述理論為基礎,應用MATLAB語言開發(fā)了一種具有良好操作性的交互式圖形用戶界面軟件Gesture。運用Gesture軟件,生物信息學研究者可以從熟悉的基因表達入手,或通過鼠標繪制并擬合出所需要的基因表達模型,進行挖掘并搜索出共表達或表達變化趨勢一致的基因表達譜數據,還可以搜索出抑制共表達和存在時延表達的基因譜數據。對搜索出的結果可以輸出并保存,依據這些相關的基因譜數據建立基因調控網絡。Gesture軟件可以高效、實用的處理基因表達譜數據,并且可以從大量的基因表達譜數據之中準確、快速提取有意義的生物學信息。
【學位授予單位】：南京林業(yè)大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：Q811.4;TP311.13

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