大蔥AfCER1基因的克隆及表達分析
發(fā)布時間:2017-12-10 02:07
本文關鍵詞:大蔥AfCER1基因的克隆及表達分析
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【摘要】:基于大蔥RNA-seq轉錄組數(shù)據(jù)庫中蠟質相關基因Af CER1的序列設計引物,利用RT-PCR(Reverse transcription-polymerase chain reaction)和RACE(Rapid amplification of c DNA ends)技術獲得Af CER1(Allium fistulisum CER1)的全長c DNA序列,并通過生物信息學手段分析基因的序列;利用RT-PCR和Real-time PCR分析Af CER1基因在大蔥野生型和突變型植株中的空間表達模式。結果表明,Af CER1基因全長為2 144 bp,包含一個1 857 bp完整的開放閱讀框(ORF),編碼618個氨基酸。蛋白序列比對分析表明,Af CER1與其他物種的CER1具有相似的結構域:脂肪酸羥化酶結構域和WAX2-C結構域。由RT-PCR的結果可知,Af CER1基因在大蔥的根、葉鞘、葉片等部位均有表達,且在野生型和突變型植株中的表達量有差異。Real-time PCR分析表明,在大蔥的根和葉鞘及剛見光的葉片中,Af CER1在突變型植株中的表達量相對野生型少;而在見光較多的葉片部位,Af CER1在突變型植株中的表達量卻比野生型多。研究可為大蔥蠟質合成的分子機制提供理論基礎。
【作者單位】: 山西大學生命科學學院;北京市農林科學院蔬菜研究中心農業(yè)部華北地區(qū)園藝作物生物學與種質創(chuàng)制重點實驗室蔬菜種質改良北京市重點實驗室;
【基金】:國家自然科學基金項目(31372066) 北京市農林科學院科技創(chuàng)新能力建設專項(KJCX201101010)
【分類號】:S633.1
【正文快照】: 與種質創(chuàng)制重點實驗室,蔬菜種質改良北京市重點實驗室,北京100097)表皮蠟質是大多數(shù)陸地植物角質層的重要組成部分,覆蓋于陸地植物的表皮,可以減緩陸地植物對生物和非生物的脅迫,如防止干旱、病蟲害,病原體和紫外輻射對植物的侵害[1-2],是植物的保護屏障。受遺傳多樣性和后天,
本文編號:1272702
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