馬氏珠母貝Sox11基因的克隆及時(shí)序表達(dá)模式分析
發(fā)布時(shí)間:2017-12-03 06:06
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【摘要】:為探究Sox(SRY-related HMG-box genes)基因家族在馬氏珠母貝個(gè)體發(fā)育及性別分化中的作用,研究首先利用兼并引物從馬氏珠母貝基因組中克隆到一個(gè)HMG框(high mobility group box),利用RACE-PCR技術(shù)從SMART c DNA文庫中克隆到一個(gè)Sox基因的c DNA全長,通過Clustal X和MEGA 4軟件對該序列進(jìn)行比對分析并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹;通過熒光定量PCR技術(shù)對該基因在不同組織及發(fā)育不同時(shí)期性腺中的表達(dá)情況進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,馬氏珠母貝該Sox基因的c DNA全長為1579 bp,其中開放閱讀框(ORF)為1008 bp,編碼336個(gè)氨基酸,5′非編碼區(qū)為126 bp,3′非編碼區(qū)為445 bp。同源性分析表明,馬氏珠母貝Sox基因與太平洋牡蠣Sox11基因的同源性(Identity)最高,為80%,故命名為pm Sox11;系統(tǒng)進(jìn)化樹分析也顯示pm Sox11與太平洋牡蠣Sox11基因的親緣關(guān)系最近。熒光定量PCR分析組織表達(dá)特異性顯示,pm Sox11在馬氏珠母貝神經(jīng)節(jié)分布較多的組織如外套膜、鰓、足、消化盲囊等大量表達(dá),在神經(jīng)節(jié)相對較少的閉殼肌和卵巢中表達(dá)量較少;時(shí)序表達(dá)圖譜顯示,pm Sox11在3月齡幼貝性腺和1年齡發(fā)育早期精巢中表達(dá)量最高,在2年齡成熟精巢和2年齡性轉(zhuǎn)換性腺中表達(dá)量降低,而在2年齡卵巢中表達(dá)量最低。研究表明,pm Sox11基因可能在馬氏珠母貝早期神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育和性別發(fā)育的調(diào)控方面起到重要作用。
【作者單位】: 廣東海洋大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院;中國科學(xué)院水生生物研究所淡水生態(tài)與生物技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:廣東海洋大學(xué)優(yōu)秀青年骨干教師培養(yǎng)項(xiàng)目(2014004) 廣東省海洋漁業(yè)科技推廣專項(xiàng)項(xiàng)目(A201308A11) 廣東海洋大學(xué)博士科研啟動基金(E15041)資助~~
【分類號】:S917.4
【正文快照】: Sox (SRY-related HMG-box genes)基因家族是近年來引起人們廣泛關(guān)注的一個(gè)基因家族。其編碼的蛋白是一類重要的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子, 其共同特點(diǎn)是都包含一個(gè)約79個(gè)氨基酸的高度保守的HMG盒區(qū)2][1, 。HMG結(jié)構(gòu)域能夠識別特異的DNA位點(diǎn), 并在其他轉(zhuǎn)錄因子的相互作用下與DNA結(jié)合, 從而,
本文編號:1247668
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