發(fā)布時(shí)間：2017-12-02 12:28

  本文關(guān)鍵詞：螺旋藻基因組中糖苷酶類(lèi)基因的序列分析

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【摘要】：在NCBI基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中可檢索到3個(gè)鈍頂螺旋藻藻株、1個(gè)極大螺旋藻藻株、1個(gè)鹽澤螺旋藻藻株和1個(gè)螺旋藻屬未定種的藻株基因組序列。6個(gè)螺旋藻基因組序列來(lái)源的糖苷酶基因共計(jì)32個(gè),編碼蛋白含260~1 084個(gè)氨基酸,BLAST序列比對(duì)顯示,與非螺旋藻種屬來(lái)源的已知序列的相似性在49%~84%之間。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,32個(gè)糖苷酶基因聚類(lèi)成8個(gè)簇,另有3個(gè)基因分別單獨(dú)構(gòu)成進(jìn)化分支。酶學(xué)功能預(yù)測(cè)顯示,這些糖苷酶基因分別屬于8個(gè)糖苷酶家族(GH3、GH9、GH13、GH23、GH25、GH38、GH57、GH104),具有8種糖苷酶催化活性(纖維素酶、溶菌酶、α-甘露糖苷酶、α-淀粉酶、普魯蘭酶、1,4-α-葡聚糖分支酶、肽聚糖結(jié)合功能、β-葡萄糖苷酶)。
【作者單位】： 中國(guó)科學(xué)院南海海洋研究所/中國(guó)科學(xué)院熱帶海洋生物資源與生態(tài)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：海南省科技興海專(zhuān)項(xiàng)(2015XH04) 廣東省海洋漁業(yè)科技與產(chǎn)業(yè)發(fā)展專(zhuān)項(xiàng)(A201501C09)
【分類(lèi)號(hào)】：Q943.2
【正文快照】： 螺旋藻(Spirulina)是一種多細(xì)胞絲狀微藻,是微藻產(chǎn)業(yè)的重要藻種,具有極高的開(kāi)發(fā)價(jià)值。螺旋藻屬于藍(lán)藻門(mén)(Cyanophyta)、段殖藻目(Hormogonales)、顫藻科(Oscillatoriaceae)、螺旋藻屬(Spirulina)。螺旋藻現(xiàn)已改名為節(jié)旋藻(Arthrospira),但由于螺旋藻這一名稱(chēng)一直被廣泛使用,因

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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7 張敏;黃芩糖苷酶的分離純化、性質(zhì)及應(yīng)用研究[D];山東大學(xué);2008年

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10 申屠旭萍;環(huán)醇類(lèi)物質(zhì)對(duì)糖苷酶抑制性的研究[D];浙江工業(yè)大學(xué);2004年

本文編號(hào)：1244942