本文關(guān)鍵詞：葡萄牙牡蠣外套膜轉(zhuǎn)錄組測序及殼色基因挖掘

  更多相關(guān)文章： 葡萄牙牡蠣 殼色 轉(zhuǎn)錄組

【摘要】：采用Illumina高通量測序平臺(tái)對(duì)黑殼與金殼葡萄牙牡蠣(Crassostrea angulata)外套膜組織開展轉(zhuǎn)錄組測序研究,其中黑殼組總計(jì)產(chǎn)出5 857 718 092 nt數(shù)據(jù),篩選后的干凈閱讀子58 004 560個(gè);金殼組產(chǎn)出6 727 447 326 nt數(shù)據(jù),干凈閱讀子66 614 854個(gè)。將發(fā)掘的新基因與COG、GO、KEGG、Swiss-Prot、NR數(shù)據(jù)庫進(jìn)行序列比對(duì),最終得到各數(shù)據(jù)庫注釋的新基因數(shù)量分別為147、397、203、567、1 347個(gè)。通過對(duì)差異表達(dá)基因的序列進(jìn)行生物學(xué)功能注釋和聚類分析以及利用已知貝殼基質(zhì)蛋白序列進(jìn)行搜索,鑒定出14條可能與殼色表達(dá)有關(guān)的貝殼基質(zhì)蛋白基因,其中5條下調(diào)基因可能與金殼基因表達(dá)相關(guān)。
【作者單位】： 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;水產(chǎn)高效健康生產(chǎn)湖南省協(xié)同創(chuàng)新中心;福建省水產(chǎn)研究所;
【基金】：現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)(CARS 48) 福建省種業(yè)工程項(xiàng)目(201451477 9) 福建省屬公益類科研院所基本科研專項(xiàng)(2015R1003 8)
【分類號(hào)】：S917.4
【正文快照】： 葡萄牙牡蠣(Crassostrea angulata)屬軟體動(dòng)物門(Mollusca),雙殼綱(Bivalvia),珍珠貝目(Pterioida),牡蠣科(Ostreidae),是廣泛分布于世界各地的重要經(jīng)濟(jì)貝類。2013年中國牡蠣的總產(chǎn)量為4 218 644 t,占全國貝類養(yǎng)殖總產(chǎn)量的33.1%[1]。為進(jìn)一步發(fā)展牡蠣生產(chǎn),目前已有關(guān)于葡萄牙

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 徐建榮;沈輝;李旭光;李小娓;;不同品系福壽螺殼色性狀的遺傳規(guī)律分析[J];江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué);2008年04期

2 管云雁;何毛賢;;海產(chǎn)經(jīng)濟(jì)貝類殼色多態(tài)性的研究進(jìn)展[J];海洋通報(bào);2009年01期

3 叢日浩;李琪;葛建龍;孔令鋒;于紅;;長牡蠣4種殼色家系子代的表型性狀比較[J];中國水產(chǎn)科學(xué);2014年03期

4 張雨;陳愛華;姚國興;吳楊平;張志偉;鄭培;沈和定;;文蛤紅殼色選育子代2種殼色群體生長與消化酶活性的比較[J];江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué);2012年03期

5 閆喜武;張躍環(huán);霍忠明;梁峻;楊鳳;張國范;;不同殼色菲律賓蛤仔品系間的雙列雜交[J];水產(chǎn)學(xué)報(bào);2008年06期

6 丁鑒鋒;楊霏;閆喜武;楊鳳;趙立強(qiáng);張國范;;不同殼色菲律賓蛤仔免疫機(jī)能的比較研究[J];大連海洋大學(xué)學(xué)報(bào);2012年05期

7 蘇家齊;閆喜武;張躍環(huán);楊鵬;張輝;楊鳳;張國范;;兩種三元雜交菲律賓蛤仔(Ruditapes philippinarum)殼色品系間的聚合雜交[J];海洋與湖沼;2013年02期

8 陳愛華;姚國興;吳楊平;張雨;;不同地理種群紅殼色文蛤的雜種優(yōu)勢[J];江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué);2014年01期

9 吳楊平;姚國興;陳愛華;張志偉;張曹進(jìn);張雨;;紅殼色文蛤選育子代各殼色的形態(tài)分化及養(yǎng)殖效果的比較[J];臺(tái)灣海峽;2012年03期

10 鄧岳文;張凌飛;杜曉東;王慶恒;黃榮蓮;;華貴櫛孔扇貝兩種殼色群體生長和消化酶活力比較[J];廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào);2008年03期

中國重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 王桂蘋;皮杰;李雪林;張健;李德亮;張婷;;大通湖兩種不同殼色形態(tài)蜆的分類與系統(tǒng)發(fā)育[A];2013年中國水產(chǎn)學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要集[C];2013年

2 戰(zhàn)欣;范飛龍;游偉偉;柯才煥;;雜色鮑殼色遺傳的研究[A];中國動(dòng)物學(xué)會(huì)·中國海洋湖沼學(xué)會(huì)貝類學(xué)分會(huì)第九次會(huì)員代表大會(huì)暨第十五次學(xué)術(shù)討論會(huì)會(huì)議摘要集[C];2011年

3 閆喜武;;菲律賓蛤仔不同殼色品系選育[A];中國動(dòng)物學(xué)會(huì)·中國海洋湖沼學(xué)會(huì)貝類學(xué)分會(huì)第九次會(huì)員代表大會(huì)暨第十五次學(xué)術(shù)討論會(huì)會(huì)議摘要集[C];2011年

4 閆喜武;;不同殼色蛤仔選育技術(shù)的建立及應(yīng)用[A];中國動(dòng)物學(xué)會(huì)·中國海洋湖沼學(xué)會(huì)貝類學(xué)分會(huì)第九次會(huì)員代表大會(huì)暨第十五次學(xué)術(shù)討論會(huì)會(huì)議摘要集[C];2011年

5 蘇家齊;閆喜武;劉振;楊鵬;;不同殼色斑馬蛤仔品系間的雙列雜交[A];中國動(dòng)物學(xué)會(huì)·中國海洋湖沼學(xué)會(huì)貝類學(xué)分會(huì)第九次會(huì)員代表大會(huì)暨第十五次學(xué)術(shù)討論會(huì)會(huì)議摘要集[C];2011年

6 楊霏;閆喜武;秦艷杰;王琳楠;梁健;桑士田;張國范;;蛤仔(Ruditapes Philippinarum)不同殼色品系遺傳多樣性分析[A];中國動(dòng)物學(xué)會(huì)·中國海洋湖沼學(xué)會(huì)貝類學(xué)分會(huì)第九次會(huì)員代表大會(huì)暨第十五次學(xué)術(shù)討論會(huì)會(huì)議摘要集[C];2011年

7 李加琦;孫輝;劉曉;;利用殼色標(biāo)記皺紋盤鮑(Haliotis discus hannai Ino)貝殼生長[A];中國動(dòng)物學(xué)會(huì)·中國海洋湖沼學(xué)會(huì)貝類學(xué)分會(huì)第九次會(huì)員代表大會(huì)暨第十五次學(xué)術(shù)討論會(huì)會(huì)議摘要集[C];2011年

8 吳楊平;陳愛華;姚國興;張志偉;張曹進(jìn);;文蛤紅殼色選育子代形態(tài)分化及養(yǎng)殖效果比較研究[A];中國動(dòng)物學(xué)會(huì)·中國海洋湖沼學(xué)會(huì)貝類學(xué)分會(huì)第九次會(huì)員代表大會(huì)暨第十五次學(xué)術(shù)討論會(huì)會(huì)議摘要集[C];2011年

9 朱曉聞;劉志剛;王輝;鄔思榮;;馬氏珠母貝四種殼色選育系F_5的生長及遺傳多樣性分析[A];中國動(dòng)物學(xué)會(huì)·中國海洋湖沼學(xué)會(huì)貝類學(xué)分會(huì)第九次會(huì)員代表大會(huì)暨第十五次學(xué)術(shù)討論會(huì)會(huì)議摘要集[C];2011年

10 張濤;鄭懷平;;華貴櫛孔扇貝不同殼色個(gè)體間表型性狀及遺傳差異的比較[A];中國動(dòng)物學(xué)會(huì)·中國海洋湖沼學(xué)會(huì)貝類學(xué)分會(huì)第九次會(huì)員代表大會(huì)暨第十五次學(xué)術(shù)討論會(huì)會(huì)議摘要集[C];2011年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 葛建龍;長牡蠣殼色性狀選育及其遺傳學(xué)分析[D];中國海洋大學(xué);2015年

2 秦艷杰;海灣扇貝遺傳圖譜構(gòu)建及殼色基因、生長相關(guān)QTL的定位研究[D];中國科學(xué)院研究生院（海洋研究所）;2006年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 張雨;不同殼色文蛤的養(yǎng)殖效應(yīng)、早期發(fā)育生長以及消化酶活性比較[D];上海海洋大學(xué);2012年

2 方文珊;馬氏珠母貝四種殼色遺傳規(guī)律及殼色雜交家系生長特性研究[D];廣東海洋大學(xué);2013年

3 張濤;華貴櫛孔扇貝養(yǎng)殖群體數(shù)量性狀及殼色遺傳的初步研究[D];汕頭大學(xué);2010年

4 陳金濤;華貴櫛孔扇貝（Chlamys nobilis）不同殼色選育系的建立及其生長發(fā)育研究[D];廣東海洋大學(xué);2011年

5 顧向飛;文蛤不同殼色花紋品系生長性狀和營養(yǎng)成分的差異分析[D];寧波大學(xué);2014年

6 齊曉艷;文蛤（Meretrix meretrix）殼色花紋性狀的分子遺傳基礎(chǔ)研究[D];寧波大學(xué);2014年

7 張勝軍;四種殼色馬氏珠母貝F_4、F_5代的研究[D];廣東海洋大學(xué);2010年

8 鄔思榮;湛江北部灣深水海域馬氏珠母貝四種殼色選育系F_5的生長速度、生長模型及其遺傳多樣性的SSR分析[D];廣東海洋大學(xué);2011年

9 張文府;馬氏珠母貝四種殼色選育系中育珠貝家系和小片貝家系的選育研究[D];廣東海洋大學(xué);2013年

10 朱東麗;文蛤（Meretrix meretrix）不同殼色花紋品系的分子標(biāo)記及DNA甲基化分析[D];中國海洋大學(xué);2011年

，

本文編號(hào)：1241781