本文關(guān)鍵詞：整合分析基因表達(dá)與拷貝數(shù)變異識別癌癥的驅(qū)動基因及調(diào)控子miRNAs

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【摘要】：目的:通過整合分析基因的表達(dá)與拷貝數(shù)變異(CNV)識別癌癥的驅(qū)動基因及調(diào)控子mi RNAs。方法:通過整合基因表達(dá)與CNV數(shù)據(jù),分別計算了乳腺癌、結(jié)腸癌、肺癌、腎癌、膀胱癌、頭頸癌六種癌癥中mi RNAs的調(diào)控得分,提出了一個識別驅(qū)動基因和顯著調(diào)控子mi RNAs的方法。結(jié)果:本文研究發(fā)現(xiàn),CNV區(qū)域上編碼的基因相比于非CNV區(qū)域上編碼的基因更傾向于受mi RNAs調(diào)控。但是,癌相關(guān)CNV區(qū)域上的基因相比正常CNV區(qū)域上的基因更少受mi RNAs調(diào)控。本研究識別出了EXOSC4、ZNF7、BOP1等原癌基因,以及mi R-488、mi R-27a、mi R-454等在多種癌癥中都起調(diào)控作用的調(diào)控子mi RNAs。結(jié)論:本文的方法為癌癥研究帶來了新的啟發(fā),這些具有調(diào)控擴(kuò)增基因過表達(dá)作用的mi RNAs的發(fā)現(xiàn),有助于我們更進(jìn)一步了解癌基因表達(dá)的復(fù)雜調(diào)控機(jī)制,進(jìn)而推動癌癥的診斷、治療和預(yù)后。
【作者單位】： 哈爾濱醫(yī)科大學(xué)生物信息科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;中國科學(xué)院上海生命科學(xué)院健康科學(xué)研究所;
【基金】：黑龍江省教育廳科技研究項目(12541278)
【分類號】：R73-3
【正文快照】： Chinese Library Classification(CLC):R749.231;Q-33 Document code:AArticle ID:1673-6273(2016)05-940-04前言拷貝數(shù)變異(Copy number variations,CNV)與疾病的關(guān)系已被越來越多的研究發(fā)現(xiàn)。CNV和基因表達(dá)間的關(guān)系也被日漸增多的研究證實[1]。Driver基因更有可能在基因組留

【共引文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號：1241492