本文關(guān)鍵詞：陸地棉PIP亞家族基因的克隆及表達特征分析

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【摘要】：該研究以陸地棉苯基香豆?jié)M芐基醚還原酶(phenylcoumaran benzylic ether reductase,PCBER)氨基酸序列為探針,利用Blastp從陸地棉基因組數(shù)據(jù)庫中發(fā)現(xiàn)了6個同源性較高的基因。根據(jù)6個基因序列設(shè)計引物,利用RT-PCR技術(shù)從陸地棉纖維細胞中克隆出了這6個基因的全長cDNA序列,分別命名為GhPCBER1、GhPCBER2、GhPCBER3、GhIFR、GhPLR1和GhPLR2。多重序列比對和進化樹分析發(fā)現(xiàn),6個蛋白均含有PIP類型蛋白的所有保守性基序和活性殘基,屬于PIP亞家族。實時熒光定量PCR結(jié)果顯示,除GhPLR1之外其他5個PIP亞家族基因均在纖維細胞中優(yōu)勢或特異表達;在纖維發(fā)育過程中,GhPCBER1、GhPCBER2、GhPCBER3和GhIFR的表達均表現(xiàn)為先上升后下降,GhPCBER1和GhPCBER2在花后21d表達量達到最高,GhPCBER3和GhIFR在花后18d達到最高,GhPLR1和GhPLR2在纖維中的表達量呈持續(xù)上升趨勢。根據(jù)基因的表達特征,推測PIP亞家族可能在棉纖維的發(fā)育過程中發(fā)揮著重要作用。
【作者單位】： 石河子大學農(nóng)學院新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團綠洲生態(tài)農(nóng)業(yè)重點實驗室;石河子大學藥學院;
【基金】：國家自然科學基金(31460360)
【分類號】：S562;Q943.2
【正文快照】： 棉花是全球性的重要經(jīng)濟作物,是紡織工業(yè)最主要的天然纖維來源。成熟棉纖維含有90%以上的纖維素和少量的非纖維素碳水化合物,如木糖葡聚糖、葡聚糖和果膠多糖等[1-2]。纖維素的合成是棉纖維發(fā)育過程中主要的代謝途徑,近期的研究表明棉纖維中存在苯丙烷代謝途徑且在纖維次生壁，

本文編號：1234746