玉米籽粒發(fā)育相關(guān)基因ZmMADS-RIN的克隆及表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2017-11-24 05:06
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【摘要】:玉米籽粒發(fā)育及產(chǎn)量是玉米重要的經(jīng)濟(jì)性狀。本研究以玉米骨干自交系鄭58為試材,采用同源克隆法得到一個(gè)與玉米籽粒發(fā)育相關(guān)的基因ZmMADS-RIN。該基因的c DNA全長(zhǎng)859 bp,開放閱讀框?yàn)?68 bp,編碼255個(gè)氨基酸,與玉米B73中所對(duì)應(yīng)的cDNA的編碼區(qū)序列相比,共有6個(gè)SNP位點(diǎn)的差異,3個(gè)氨基酸殘基發(fā)生了變化。生物信息學(xué)分析表明,ZmMADS-RIN蛋白的相對(duì)分子量為29.23 k D,理論等電點(diǎn)為8.84,是一種親水性蛋白,不含信號(hào)肽序列,也不含跨膜結(jié)構(gòu);具有5個(gè)磷酸化位點(diǎn);二級(jí)結(jié)構(gòu)中含有50.20%的α-螺旋(alpha helix)、27.45%的無規(guī)則卷曲(random coil)、14.51%的延伸鏈(extended strand)和7.84%的β-轉(zhuǎn)角(beta turn)。該蛋白位于細(xì)胞核內(nèi);其氨基酸序列中含有高度保守的MADS結(jié)構(gòu)域、相對(duì)保守的K結(jié)構(gòu)域、低保守的I結(jié)構(gòu)域和最不穩(wěn)定的C結(jié)構(gòu)域,是典型的MIKC型MADS-box蛋白;系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明,ZmMADS-RIN蛋白屬于AGL6分支,與水稻基因Os MADS6的相似性最高,為89%。ZmMADS-RIN基因在玉米自交系鄭58的籽粒中特異表達(dá),在根及不同時(shí)期的葉片中沒有檢測(cè)到表達(dá)信號(hào)。熒光定量PCR結(jié)果顯示,ZmMADS-RIN基因的表達(dá)量在玉米籽粒發(fā)育的不同階段呈一定規(guī)律的變化,在授粉后0~20d,呈上調(diào)表達(dá)趨勢(shì),授粉后25 d表達(dá)量迅速下降至較低水平,而在授粉后30~40 d則檢測(cè)不到其表達(dá)。推測(cè)該基因可能與玉米籽粒的發(fā)育有關(guān)。
【作者單位】: 河南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院/小麥玉米作物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31371629)資助~~
【分類號(hào)】:S513
【正文快照】: 本研究由國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31371629)資助。This study was supported by the National Natural Science Foundation of China(31371629).URL:http://www.cnki.net/kcms/detail/11.1809.S.20160704.0826.020.htmlMADS-box基因編碼一種重要的轉(zhuǎn)錄因子,參與調(diào)節(jié)真核生物的發(fā)
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1 張燁;鄒湘軍;方壯東;李建民;李長(zhǎng)友;;玉米籽粒的壓縮力學(xué)特性研究[J];廣東農(nóng)業(yè)科學(xué);2012年20期
2 B.д.普卡陀夫;翟允y,
本文編號(hào):1221083
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