玉米籽粒發(fā)育相關基因ZmMADS-RIN的克隆及表達分析
發(fā)布時間:2017-11-24 05:06
本文關鍵詞:玉米籽粒發(fā)育相關基因ZmMADS-RIN的克隆及表達分析
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【摘要】:玉米籽粒發(fā)育及產量是玉米重要的經濟性狀。本研究以玉米骨干自交系鄭58為試材,采用同源克隆法得到一個與玉米籽粒發(fā)育相關的基因ZmMADS-RIN。該基因的c DNA全長859 bp,開放閱讀框為768 bp,編碼255個氨基酸,與玉米B73中所對應的cDNA的編碼區(qū)序列相比,共有6個SNP位點的差異,3個氨基酸殘基發(fā)生了變化。生物信息學分析表明,ZmMADS-RIN蛋白的相對分子量為29.23 k D,理論等電點為8.84,是一種親水性蛋白,不含信號肽序列,也不含跨膜結構;具有5個磷酸化位點;二級結構中含有50.20%的α-螺旋(alpha helix)、27.45%的無規(guī)則卷曲(random coil)、14.51%的延伸鏈(extended strand)和7.84%的β-轉角(beta turn)。該蛋白位于細胞核內;其氨基酸序列中含有高度保守的MADS結構域、相對保守的K結構域、低保守的I結構域和最不穩(wěn)定的C結構域,是典型的MIKC型MADS-box蛋白;系統(tǒng)進化樹分析表明,ZmMADS-RIN蛋白屬于AGL6分支,與水稻基因Os MADS6的相似性最高,為89%。ZmMADS-RIN基因在玉米自交系鄭58的籽粒中特異表達,在根及不同時期的葉片中沒有檢測到表達信號。熒光定量PCR結果顯示,ZmMADS-RIN基因的表達量在玉米籽粒發(fā)育的不同階段呈一定規(guī)律的變化,在授粉后0~20d,呈上調表達趨勢,授粉后25 d表達量迅速下降至較低水平,而在授粉后30~40 d則檢測不到其表達。推測該基因可能與玉米籽粒的發(fā)育有關。
【作者單位】: 河南農業(yè)大學農學院/小麥玉米作物學國家重點實驗室;
【基金】:國家自然科學基金項目(31371629)資助~~
【分類號】:S513
【正文快照】: 本研究由國家自然科學基金項目(31371629)資助。This study was supported by the National Natural Science Foundation of China(31371629).URL:http://www.cnki.net/kcms/detail/11.1809.S.20160704.0826.020.htmlMADS-box基因編碼一種重要的轉錄因子,參與調節(jié)真核生物的發(fā)
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1 張燁;鄒湘軍;方壯東;李建民;李長友;;玉米籽粒的壓縮力學特性研究[J];廣東農業(yè)科學;2012年20期
2 B.д.普卡陀夫;翟允y,
本文編號:1221083
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