本文關(guān)鍵詞：當(dāng)歸咖啡酸-O-甲基轉(zhuǎn)移酶基因克隆和序列分析

  更多相關(guān)文章： 當(dāng)歸 咖啡酸-O-甲基轉(zhuǎn)移酶 基因克隆 生物信息學(xué)分析 信號(hào)肽

【摘要】：目的克隆當(dāng)歸Angelica sinensis咖啡酸-O-甲基轉(zhuǎn)移酶(caffeic acid O-methyltransferases,COMT)編碼基因全長(zhǎng)c DNA,并對(duì)序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析。方法提取當(dāng)歸葉片總RNA為c DNA合成模板,利用同源克隆結(jié)合c DNA末端快速擴(kuò)增(RACE)技術(shù)克隆當(dāng)歸COMT全長(zhǎng)c DNA,并利用NCBI、Ex PASy網(wǎng)站上的Blast N、Blast P、ORF Finder、Compute PI/Mw、Prot Scale、PROSITE、SWISS-MODEL等序列在線分析工具和MEGA、DNAMAN生物信息學(xué)軟件對(duì)序列進(jìn)行分析。結(jié)果獲得COMT全長(zhǎng)c DNA序列,并在Gen Bank注冊(cè)(登錄號(hào)KP188587)。序列分析表明,克隆的c DNA全長(zhǎng)為1 436 bp,其中包括5’-UTR(76 bp)和3’-UTR(362 bp),含有1個(gè)1 098 bp的完整開(kāi)放閱讀框(opening reading frame,ORF),編碼365個(gè)氨基酸的多肽鏈;預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量為40 230,理論等電點(diǎn)(p I)為5.43;無(wú)信號(hào)肽,具有典型的II型氧甲基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域SAM_OMT_II。結(jié)論首次克隆當(dāng)歸COMT基因全長(zhǎng)c DNA,為當(dāng)歸COMT基因功能研究和當(dāng)歸阿魏酸生物合成與調(diào)控的機(jī)制研究奠定基礎(chǔ)。
【作者單位】： 甘肅中醫(yī)藥大學(xué);
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81260616,81060327)
【分類號(hào)】：S567.239
【正文快照】： 當(dāng)歸Angelica sinensis(Oliv.)Diels是我國(guó)傳統(tǒng)常用中藥,味甘、辛,性溫,歸肝、心、脾經(jīng);具有補(bǔ)血活血、調(diào)經(jīng)止痛、潤(rùn)腸通便等功效[1]。近年來(lái)由于當(dāng)歸引種區(qū)域擴(kuò)大,栽培面積和產(chǎn)量持續(xù)增加以及全球氣候變化等自然和人為因素的影響,當(dāng)歸藥材品質(zhì)面臨著巨大挑戰(zhàn),開(kāi)展品質(zhì)形成相

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 謝廣成;李丹彤;周立敬;;刺參甘露糖結(jié)合凝集素的生物信息學(xué)分析[J];生物技術(shù)通報(bào);2011年02期

2 侯李君;王學(xué)魁;施定基;;藍(lán)藻磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的生物信息學(xué)分析[J];生物技術(shù)通報(bào);2008年04期

3 李鳳梅;;植物絲裂原活化蛋白激酶激酶的生物信息學(xué)分析[J];北方園藝;2010年03期

4 王漢屏;;不同植物防御素的生物信息學(xué)分析[J];植物生理學(xué)通訊;2008年01期

5 趙小峰;葛保健;;FoxA1蛋白的生物信息學(xué)分析[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2012年24期

6 孫桂榮;張虎;康相濤;陳其新;李紅;王樂(lè);;雞miR-181a靶基因的生物信息學(xué)分析[J];河南農(nóng)業(yè)科學(xué);2011年05期

7 李鵬;饒燦;彭江;李想韻;宋鋒;孫一銘;孫敏;;植物黃烷酮3-羥化酶的生物信息學(xué)分析[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2010年06期

8 魏琦超;暢麗萍;薛曉鋒;周巖;;大豆異戊烯焦磷酸異構(gòu)酶基因的電子克隆及生物信息學(xué)分析[J];生物技術(shù)通報(bào);2010年11期

9 程抒R，

本文編號(hào)：1220332