本文關(guān)鍵詞：紅花轉(zhuǎn)錄物組中篩選的Unigene100791基因克隆、生物信息學(xué)分析及功能預(yù)測(cè)

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【摘要】：目的:克隆紅花Unigene100791基因,研究其表達(dá)情況;并對(duì)該基因的特性進(jìn)行生物信息學(xué)分析,為后續(xù)紅花代謝調(diào)控及提高紅花油產(chǎn)量,使其滿足食品工業(yè)市場(chǎng)需求奠定理論基礎(chǔ)。方法:從紅花轉(zhuǎn)錄物組數(shù)據(jù)庫中篩選得到轉(zhuǎn)錄因子Dof相關(guān)基因Unigene100791的中間片段;利用RNAiso plus試劑法提取紅花種子總RNA,利用RT-PCR方法反轉(zhuǎn)錄得到紅花種子c DNA;采用3'Race方法從紅花種子中克隆Unigene100791基因的全長(zhǎng)序列;通過生物信息學(xué)方法對(duì)其全長(zhǎng)基因進(jìn)行分析,構(gòu)建該基因與相關(guān)物種的系統(tǒng)進(jìn)化樹,研究其蛋白序列的同源性及其理化性質(zhì)與結(jié)構(gòu)特征,預(yù)測(cè)其生物學(xué)功能。結(jié)果:成功克隆了紅花Unigene100791基因,其基因全長(zhǎng)1274 bp;開放閱讀框981 bp,編碼326個(gè)氨基酸,理論分子質(zhì)量約為35026.5 u,理論等電點(diǎn)9.5,帶正電殘基27個(gè),帶負(fù)電殘基18個(gè),序列含有典型的加尾信號(hào)poly(A);紅花Unigene100791基因編碼產(chǎn)物與煙草Dof2.4-1親緣關(guān)系較近,屬于Dof超家族,此蛋白存在信號(hào)肽,不存在跨膜結(jié)構(gòu)。結(jié)論:成功克隆了紅花Unigene100791基因,并對(duì)其編碼的蛋白質(zhì)進(jìn)行了生物信息學(xué)分析。
【作者單位】： 長(zhǎng)春師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)生物反應(yīng)器與藥物開發(fā)教育部工程研究中心;
【分類號(hào)】：TS201.3
【正文快照】： 轉(zhuǎn)錄因子,亦稱為反式作用因子,是參與真核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄調(diào)控的一類細(xì)胞核內(nèi)蛋白質(zhì)因子。轉(zhuǎn)錄因子能夠與真核基因啟動(dòng)子區(qū)域中的順式作用元件發(fā)生特異性相互作用來調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄的活性[1],在基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄水平上起著關(guān)鍵作用。轉(zhuǎn)錄因子廣泛的存在于動(dòng)植物體中,尤其是在植物的生長(zhǎng)發(fā)育過

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1 陸志城;你方唱罷我登場(chǎng)[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報(bào);2002年

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本文編號(hào)：1217164