本文關(guān)鍵詞：has-miR-16靶基因預(yù)測(cè)及生物信息學(xué)分析

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【摘要】：目的預(yù)測(cè)has-miR-16靶基因并對(duì)靶基因的分子功能、生物學(xué)過(guò)程和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路富集性分析,全面認(rèn)識(shí)miR-16涉及的生命過(guò)程和疾病。方法通過(guò)閱讀文獻(xiàn)結(jié)合生物信息學(xué)預(yù)測(cè)的方法得出靶基因集合,用Cytoscape 3.2.1軟件和DAVID(the database for annnotation visualization and integrated discovery)數(shù)據(jù)庫(kù)分別對(duì)靶基因GO(gene ontology)注釋和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路進(jìn)行富集性分析。結(jié)果各物種已知的成熟miR-16序列具有高度保守性。397個(gè)靶基因在分子功能上顯著富集于蛋白結(jié)合、DNA結(jié)合、酶類(lèi)活性、胰島素樣生長(zhǎng)因子受體活性等功能,在生物學(xué)過(guò)程顯著富集于發(fā)育過(guò)程、細(xì)胞粘附、神經(jīng)發(fā)生、細(xì)胞代謝和細(xì)胞周期調(diào)控等過(guò)程。靶基因顯著富集的信號(hào)通路有癌癥通路、p53信號(hào)通路、神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子信號(hào)通路等通路。結(jié)論從分析結(jié)果得出has-miR-16通過(guò)調(diào)控靶基因參與了人類(lèi)生命活動(dòng)和疾病過(guò)程的很多方面,尤其在癌癥的病理過(guò)程是一個(gè)值得進(jìn)一步研究的方向。
【作者單位】： 南華大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院預(yù)防醫(yī)學(xué)系;南華大學(xué)藥學(xué)與生物科學(xué)學(xué)院生物學(xué)系;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(81273026) 湖南省衛(wèi)生廳科研基金(B2011-044)
【分類(lèi)號(hào)】：R3416
【正文快照】： MicroRNA是一類(lèi)在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因表達(dá)的內(nèi)生的、長(zhǎng)度為20~24個(gè)核苷酸的非編碼小RNA[1]。其作用途徑為通過(guò)整合到RNA沉默復(fù)合物中,然后在哺乳動(dòng)物體內(nèi)基于與mRNA的3'非翻譯區(qū)不完全匹配來(lái)調(diào)節(jié)靶基因表達(dá)[2]。miRNA通過(guò)調(diào)控靶基因表達(dá)的方式參與人類(lèi)大部分的生物學(xué)過(guò)程和疾，

本文編號(hào)：1209619