本文關(guān)鍵詞：油棕等熱帶植物DXS基因的生物信息學(xué)分析

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【摘要】：油棕等熱帶植物含有豐富的胡蘿卜素和維生素E等類異戊二烯物質(zhì),類胡蘿卜素和甾醇等類異戊二烯物質(zhì)在植物生命活動(dòng)中扮演重要角色,并且對保護(hù)人類健康具有重要意義,MEP途徑是合成類異戊二烯的重要途徑之一。DXS是MEP途徑中的第一個(gè)限速酶,其功能在油棕等熱帶植物中極其保守。為了弄清油棕等熱帶植物DXS的結(jié)構(gòu)和功能特點(diǎn),該研究利用生物信息學(xué)工具和軟件對以油棕等熱帶植物類異戊二烯合成關(guān)鍵基因DXS為對象,進(jìn)行核酸和氨基酸序列的理化性質(zhì)、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)以及功能結(jié)構(gòu)域等分析,探討了不同物種間的親緣關(guān)系。結(jié)果表明:DXS基因起始密碼子均為ATG,終止密碼子則分為TAG、TAA和TGA,DXS蛋白質(zhì)屬于不具有信號肽的親水性蛋白,可能作為轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在葉綠體基質(zhì)中發(fā)揮作用,未發(fā)現(xiàn)明顯的跨膜結(jié)構(gòu)域,磷酸化位點(diǎn)有36個(gè),其中絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸位點(diǎn)分別為17、11和8個(gè),無規(guī)則卷曲和α-螺旋是蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)主要的結(jié)構(gòu)元件,三級結(jié)構(gòu)預(yù)測具有DXS酶特征,硫胺素焦磷酸鹽結(jié)合位點(diǎn)和PLN02582保守結(jié)構(gòu)域,不同植物DXS功能結(jié)構(gòu)域非常保守,可以作為判斷不同物種間親緣關(guān)系的重要依據(jù)。該研究結(jié)果為油棕等熱帶植物DXS的結(jié)構(gòu)、功能分析和利用提供了進(jìn)一步的信息,為其品質(zhì)性狀分子機(jī)制研究及遺傳改良奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】： 中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院椰子研究所海南省熱帶油料作物生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：國家林業(yè)局“948”項(xiàng)目(No.2013-4-40)~~
【分類號】：Q943.2
【正文快照】： 油棕(Elaeis guineensis Jacq.)屬棕櫚科多年生喬木,是熱帶產(chǎn)油植物,果實(shí)中類胡蘿卜素的含量是決定油棕品質(zhì)的一個(gè)重要指標(biāo)。粗棕櫚油中含有600 mg·kg-1類胡蘿卜素,其中80%都是β-胡蘿卜素和α-胡蘿卜素,這也是粗棕櫚油呈黃色或紅棕色的原因(雷新濤和曹紅星,2013)。巴西橡膠

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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5 Nazia Nisar;Li Li;Shan Lu;Nay Chi Khin;Barry J.Pogson;;Carotenoid Metabolism in Plants[J];Molecular Plant;2015年01期

6 石鵬;曹紅星;李東霞;王永;雷新濤;;油棕等熱帶植物DXS基因的生物信息學(xué)分析[J];廣西植物;2016年04期

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【二級參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 王婧;李冰;劉翠翠;夏吉鵬;張繼瑜;;牛巴貝斯蟲DXS基因的克隆和真核表達(dá)[J];中國農(nóng)業(yè)科學(xué);2014年06期

中國重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

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本文編號：1197686