硬枝樹花中非核糖體多肽合成酶NRPS基因的克隆與鑒定
發(fā)布時間:2017-11-16 21:18
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【摘要】:以硬枝樹花(Ramalina conduplicans)地衣型真菌為研究材料,采用簡并引物擴(kuò)增獲得腺苷;Y(jié)構(gòu)域(A結(jié)構(gòu)域),并以其為模板,通過Gene walking的方法獲得非核糖體多肽合成酶(NRPSs)基因的全長,并對Rc NRPS基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析、分子系統(tǒng)進(jìn)化分析及RT-PCR分析。Rc NRPS基因的開放閱讀框總長3 150 bp,編碼1 049個氨基酸殘基。結(jié)構(gòu)域分析顯示:硬枝樹花的NRPS基因含有腺苷;Y(jié)構(gòu)域(A結(jié)構(gòu)域)、巰基化結(jié)構(gòu)域(T結(jié)構(gòu)域)、縮合結(jié)構(gòu)域(C結(jié)構(gòu)域)。將硬枝樹花的Rc NRPS蛋白序列與曲霉屬34條NRPS蛋白構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果顯示其為鐵載體。生物信息學(xué)分析表明:NRPSs為非分泌蛋白,定位于細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)中。RT-PCR分析表明:酵母粉是Rc NRPS基因誘導(dǎo)表達(dá)所必需的,蔗糖可有效促進(jìn)該基因的誘導(dǎo)表達(dá)。
【作者單位】: 云南省林業(yè)科學(xué)院云南省森林植物培育與開發(fā)利用重點(diǎn)實驗室國家林業(yè)局云南珍稀瀕特森林植物保護(hù)和繁育重點(diǎn)實驗室;西南林業(yè)大學(xué)林學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金項目(31400488) 云南省應(yīng)用基礎(chǔ)研究計劃面上項目(2016FB055) 云南省對外科技合作計劃項目(2015IA004)共同資助
【分類號】:Q949.3
【正文快照】: Isolation and Identification of Nonribosomal Peptides Synthetases(NRPS)from Ramalina conduplicansYuan Xiaolong1Zhao Neng2Chen Jian1Wang Juan1Yang Yuming1Wang Yi1*1 Key Laboratory for Conservation of Rare,EndangerEndemic Forest Plants,State Forestry Admi
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1 王晗;王永;紀(jì)燕玲;王志偉;;NRPS基因在我國Epichlo(e|¨),Neotyphdium,Claviceps和Eurotium屬真菌中分布的檢測[A];中國菌物學(xué)會第五屆會員代表大會暨2011年學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2011年
,本文編號:1193723
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