芋淀粉合成酶AGPase基因的克隆及表達分析
發(fā)布時間:2017-11-14 15:30
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【摘要】:通過對‘靖江香沙芋’轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行功能注釋,克隆獲得‘靖江香沙芋’淀粉合成酶AGPase的基因,序列全長為1 596 bp,命名為CeApS1(NCBI:Colocasia KU288757,未公布)。該基因編碼532個氨基酸,蛋白含有1個NTP_transf_3結(jié)構(gòu)域(Gly~(104)~Pro~(306))和1個Pb H1結(jié)構(gòu)域(Gly~(473)~Ser~(515)),編碼產(chǎn)生AGPase小亞基,等電點和分子量分別為6.73和57.6 k D。ApS1在單子葉和雙子葉植物中廣泛存在,CeApS1與紫萍(AIZ00992.1)中相應(yīng)蛋白的親緣關(guān)系最近,相似性為83.4%,與草莓(AAS00541.1)、苜蓿(XP_003617925.1)、水稻(AAK27313.1)和小麥(CAA46879.1)等植物中相應(yīng)蛋白的親緣關(guān)系較遠。CeApS1在‘靖江香沙芋’的母芋和子孫芋中表達量較高,在葉片、葉柄和根中低表達。芋球莖中的CeApS1表達水平與球莖發(fā)育密切相關(guān),在播種160 d后達到最大值。該基因的表達模式與球莖淀粉含量的積累顯著正相關(guān)。
【作者單位】: 江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟作物研究所;
【基金】:國家自然科學(xué)基金青年基金項目(31501776) 江蘇省自然科學(xué)基金青年基金項目(BK20140752) 江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院基本科研業(yè)務(wù)專項[ZX(15)4014]
【分類號】:S632.3
【正文快照】: 芋[Colocasia esculenta(L.)Schott]的球莖淀粉含量很高,可達干物質(zhì)量的70%~80%,其淀粉顆粒較小,直徑一般小于5μm(Agama-Acevedo et al.,2011),且易于消化,具有較好的食療保健功能。芋的淀粉在食品工業(yè)中的用途也很廣泛(曹新志等,2012)。 淀粉的生物合成過程十分復(fù)雜,參與淀,
本文編號:1185985
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