本文關(guān)鍵詞：牛MARK2、CREB5基因的克隆和生物信息學(xué)分析

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【摘要】：試驗(yàn)旨在對(duì)牛MARK2、CREB5基因進(jìn)行克隆和生物信息學(xué)分析。首先在GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中利用人MARK2和CREB5基因序列比對(duì)獲得牛的表達(dá)序列標(biāo)簽(ESTs)的序列,進(jìn)行引物設(shè)計(jì)并利用RT-PCR方法從牛肩胛骨肌肉中克隆出MARK2和CREB5基因的cDNA序列,補(bǔ)足空缺部分,最終獲得牛MARK2和CREB5基因。通過(guò)對(duì)牛MARK2和CREB5基因的生物學(xué)特性進(jìn)行分析可知:牛MARK2基因的編碼區(qū)長(zhǎng)為2 076bp,編碼691個(gè)氨基酸,CREB5基因的編碼區(qū)長(zhǎng)1 527bp,編碼508個(gè)氨基酸;經(jīng)蛋白質(zhì)理化性質(zhì)預(yù)測(cè)MARK2和CREB5蛋白均為親水性蛋白;MARK2和CREB5蛋白的磷酸化位點(diǎn)均分布于蘇氨酸(Thr)、絲氨酸(Ser)和酪氨酸(Tyr)殘基上;MARK2蛋白與CREB5蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)以無(wú)規(guī)則卷曲為主;亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)MARK2蛋白主要分布在細(xì)胞質(zhì)中,CREB5蛋白主要分布在細(xì)胞核中,兩者均不屬于分泌型蛋白;MARK2蛋白保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)含1個(gè)S_TKc和1個(gè)UBA功能結(jié)構(gòu)域,CREB5蛋白保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)含有1個(gè)ZnF_C2H2、1個(gè)BRLZ功能結(jié)構(gòu)域和5個(gè)低復(fù)雜度區(qū)域且二者均不具有跨膜結(jié)構(gòu)。
【作者單位】： 天津農(nóng)學(xué)院動(dòng)物科學(xué)與動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院;
【基金】：國(guó)家轉(zhuǎn)基因重大專項(xiàng):高產(chǎn)轉(zhuǎn)基因肉牛新品種培育(2014ZX08007—002)
【分類(lèi)號(hào)】：Q78
【正文快照】： 牛肉作為高營(yíng)養(yǎng)價(jià)值的保健型肉食品,具有高蛋白、低脂肪、低膽固醇等特點(diǎn),越來(lái)越受到人們的關(guān)注[1]。牛肉品質(zhì)受肌內(nèi)脂肪含量、脂肪酸組成、大理石紋、嫩度、pH、肉色及風(fēng)味等因素的影響,而牛的健康狀況又直接決定著牛肉的肉品質(zhì),研究表明利用遺傳育種方法改善牛肉品質(zhì)切實(shí)可

【參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1156275