牛MARK2、CREB5基因的克隆和生物信息學分析
本文關鍵詞:牛MARK2、CREB5基因的克隆和生物信息學分析
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【摘要】:試驗旨在對牛MARK2、CREB5基因進行克隆和生物信息學分析。首先在GenBank數(shù)據(jù)庫中利用人MARK2和CREB5基因序列比對獲得牛的表達序列標簽(ESTs)的序列,進行引物設計并利用RT-PCR方法從牛肩胛骨肌肉中克隆出MARK2和CREB5基因的cDNA序列,補足空缺部分,最終獲得牛MARK2和CREB5基因。通過對牛MARK2和CREB5基因的生物學特性進行分析可知:牛MARK2基因的編碼區(qū)長為2 076bp,編碼691個氨基酸,CREB5基因的編碼區(qū)長1 527bp,編碼508個氨基酸;經(jīng)蛋白質(zhì)理化性質(zhì)預測MARK2和CREB5蛋白均為親水性蛋白;MARK2和CREB5蛋白的磷酸化位點均分布于蘇氨酸(Thr)、絲氨酸(Ser)和酪氨酸(Tyr)殘基上;MARK2蛋白與CREB5蛋白的二級結構預測以無規(guī)則卷曲為主;亞細胞定位預測MARK2蛋白主要分布在細胞質(zhì)中,CREB5蛋白主要分布在細胞核中,兩者均不屬于分泌型蛋白;MARK2蛋白保守結構域預測含1個S_TKc和1個UBA功能結構域,CREB5蛋白保守結構域預測含有1個ZnF_C2H2、1個BRLZ功能結構域和5個低復雜度區(qū)域且二者均不具有跨膜結構。
【作者單位】: 天津農(nóng)學院動物科學與動物醫(yī)學學院;
【基金】:國家轉基因重大專項:高產(chǎn)轉基因肉牛新品種培育(2014ZX08007—002)
【分類號】:Q78
【正文快照】: 牛肉作為高營養(yǎng)價值的保健型肉食品,具有高蛋白、低脂肪、低膽固醇等特點,越來越受到人們的關注[1]。牛肉品質(zhì)受肌內(nèi)脂肪含量、脂肪酸組成、大理石紋、嫩度、pH、肉色及風味等因素的影響,而牛的健康狀況又直接決定著牛肉的肉品質(zhì),研究表明利用遺傳育種方法改善牛肉品質(zhì)切實可
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本文編號:1156275
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