重亞硫酸氫鹽測序法檢測Wnt信號通路抑制基因在急性早幼粒細胞白血病細胞中甲基化變化
發(fā)布時間:2017-11-07 01:21
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【摘要】:目的:應用重亞硫酸氫鹽測序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)檢測急性早幼粒細胞白血病細胞株(NB4)Wnt信號通路抑制基因啟動子區(qū)CPG島的甲基化狀態(tài),篩選NB4細胞中高甲基化的Wnt信號通路抑制基因,并探討B(tài)SP法作為定量研究基因甲基化方法的優(yōu)缺點。方法:以NB4細胞為研究對象,20例健康人單個核細胞為對照;常規(guī)提取DNA并用亞硫酸氫鹽處理,然后用PCR擴增目標序列,應用重亞硫酸氫鹽測序法(BSP)分析在NB4細胞中Wnt信號通路抑制基因基因的甲基化狀態(tài)。并通過與甲基化特異性PCR(methylation specific PCR,M SP)、焦磷酸測序技術(shù)(pyrosequencing)比較、評價BSP法檢測NB4細胞Wnt信號通路抑制基因甲基化狀態(tài)的優(yōu)缺點。結(jié)果:BSP產(chǎn)物克隆測序檢測NB4細胞Wnt信號通路抑制基因甲基化發(fā)生率分別為:WIF-1基因95.26%,DKK3基因86%,SFRP1基因81.67%,SFRP2基因95.71%,SFRP4基因85%,SFRP5基因95%;20例健康人單個核細胞為對照組中Wnt信號通路抑制基因甲基化發(fā)生率分別為:WIF-1基因1.5%,DKK3基因4.2%,SFRP1基因0%,SFRP2基因0.9%,SFRP4基因2.5%,SFRP5基因1.75%。與正常人M NC相比,NB4細胞的Wnt信號通路相關(guān)抑制基因啟動子甲基化率明顯增高。結(jié)論:急性早幼粒細胞株NB4細胞中存在Wnt信號通路多個抑制基因高甲基化狀態(tài)。此類基因異常甲基化有可能成為急性早幼粒細胞白血病的早期診斷指標和治療靶點。
【作者單位】: 福建省血液病研究所福建省血液病血重點實驗室福建醫(yī)科大學附屬協(xié)和醫(yī)院;
【基金】:國家自然科學基金項目(81300428,81370629) 國家和福建省臨床重點專科建設項目資助(2010301#)
【分類號】:R733.71
【正文快照】: found in the Wnt signaling pathw ay of the acute promyelocytic leukemia NB4 cells,w hich may be served as one of theearly diagnosis index and therapeutic target of the acute promyelocytic leukemia.J Exp Hematol 2016;(5):1299-1304Wnt信號轉(zhuǎn)導通路(wingless
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本文編號:1150225
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