本文關鍵詞：中東呼吸綜合征冠狀病毒結構蛋白與附屬蛋白編碼基因密碼子偏愛性分析

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【摘要】：中東呼吸綜合征冠狀病毒是一類對人類危害極重的RNA病毒,為了解其密碼子使用特點和主要影響因素,該文采用CHIPS、CUSP、CodonW和SPSS軟件對MERS-CoV 9條基因序列進行了偏愛性分析和多元統(tǒng)計分析,獲得了每個基因密碼子3個位置的GC含量和ENC值以及所有基因序列的RSCU值,并與大腸桿菌、酵母、人的密碼子使用頻率進行了對比分析。結果顯示GC3明顯低于GC2、GC1且小于50%,ENC值為50.59,表明該病毒密碼子偏愛性偏低且偏愛以A、T堿基結尾的密碼子。中性繪圖和ENC繪圖分析表明密碼子的偏愛性主要受到選擇作用的影響。通過和其它三種生物密碼子使用頻率進行比較,發(fā)現(xiàn)其與酵母密碼子使用頻率相差最小。在此基礎上確定了MERS-CoV的19個最優(yōu)密碼子。研究結果對MERS-CoV尋找最佳宿主進行體外表達,從而研發(fā)基因工程疫苗及治療性抗體具有一定的意義。
【作者單位】： 四川農業(yè)大學生命科學學院;
【基金】：2013年四川省教育廳青年基金項目 2015年四川農業(yè)大學生命科學學院學科建設項目 四川農業(yè)大學雙支計劃
【分類號】：R373
【正文快照】： 生物體遺傳信息傳遞遵循“中心法則”,貯存在DNA上的遺傳信息通過mRNA傳遞到蛋白質上,mRNA通過三聯(lián)體密碼子與氨基酸聯(lián)系在一起,編碼同一氨基酸的不同密碼子稱為該氨基酸的同義密碼子。研究表明,生物體內同義密碼子的使用并不是隨機的,而是不同物種或同一物種的不同基因在編碼

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