發(fā)布時(shí)間：2017-11-05 00:04

  本文關(guān)鍵詞：原核微藻psbA基因的密碼子偏好性及聚類分析

  更多相關(guān)文章： 原核微藻 psb A 密碼子偏好性 系統(tǒng)聚類

【摘要】：D1蛋白是光合作用反應(yīng)中心的一種蛋白,研究編碼該蛋白的psb A基因密碼子的偏好性及聚類分析對(duì)原核微藻的分類具有重要意義。本研究利用MEGA和Codon W軟件分析psb A基因的堿基組成和密碼子適應(yīng)指數(shù)、有效密碼子數(shù)及相對(duì)密碼子使用度等參數(shù)。結(jié)果表明,不同種屬原核微藻的psb A基因具有明顯的密碼子偏好性,且密碼子使用模式多樣,可反映該類群生物種屬之間的親緣關(guān)系。依據(jù)密碼子偏好性的歐式平方距離系數(shù)進(jìn)行聚類,證實(shí)密碼子的偏好性與其物種的親緣關(guān)系及進(jìn)化存在一定的關(guān)系,其聚類結(jié)果可作為系統(tǒng)發(fā)育分析的重要補(bǔ)充。
【作者單位】： 天津商業(yè)大學(xué)生物技術(shù)與食品科學(xué)學(xué)院/天津市食品生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(31270050) 創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目(140028)
【分類號(hào)】：Q943.2
【正文快照】： 原核微藻是光合自養(yǎng)微生物的統(tǒng)稱,其中有些種類是生產(chǎn)食品的原料;有些種類富含生物活性物質(zhì),可應(yīng)用于醫(yī)藥領(lǐng)域或作為食品添加劑應(yīng)用于功能食品開發(fā)。然而由于原核微藻個(gè)體微小、形態(tài)簡(jiǎn)單,基于形態(tài)特征的分類系統(tǒng)不能很好反映它們之間的親緣關(guān)系,也無(wú)法滿足新分離藻株的鑒定需

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