小反芻獸疫全基因序列分析與核衣殼蛋白在昆蟲細(xì)胞中的表達(dá)
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【摘要】:小反芻獸疫(Pest des petits ruminants,PPR)是由小反芻獸疫病毒(Pest des petits ruminants virus,PPRV)引起的烈性傳染病,其病毒主要危害山羊、綿羊等小反芻獸,以突然發(fā)病、高熱稽留、口瘡、流鼻涕、腹瀉等主要病癥,因其發(fā)病率和死亡率高,傳播速度快,被世界動(dòng)物衛(wèi)生組織(The World Organisation for Animal Health,OIE)列為A類烈性重大傳染病之一。小反芻獸疫病毒于2007年7月在我國西藏首次發(fā)現(xiàn),相繼在2013年新疆伊犁大爆發(fā),引起大批量的山羊、綿羊死亡,給養(yǎng)殖戶帶來巨大損失。隨后在我國20多個(gè)省、市大量流行、傳播。各地的有關(guān)部門也重視了該病毒的危害性,積極采取措施預(yù)防。筆者于2014年春季在廣東省某羊場送檢的樣本中首次檢測到了小反芻獸疫病毒,并把該毒株命名為CH/GDDG/2014。本研究對其全基因組特征、N基因抗原活性等進(jìn)行了研究,有助于了解小反芻獸疫病毒的分子流行病學(xué),也為小反芻獸疫病毒的診斷研究奠定基礎(chǔ)。本研究內(nèi)容及結(jié)果如下:1.本研究利用RT-PCR分11段重疊cDNA擴(kuò)增小反芻獸疫病毒基因全長序列獲得PPRV全基因組,并命名為CH/GDDG/2014株,經(jīng)序列測定與GenBank中收錄的23條小反芻獸疫參考毒株的序列進(jìn)行核苷酸同源性分析,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果顯示CH/GDDG/2014株基因組含有15954個(gè)核苷酸,獲得的全長序列比國外分離的毒株要多6個(gè)核苷酸(TCCCTC),由于這6個(gè)核苷酸的插入可能導(dǎo)致病毒滴度降低,對細(xì)胞的培養(yǎng)造成一定的困難。該基因組包括六個(gè)開放閱讀框(ORFs)分別編碼核衣殼蛋白,磷蛋白,基質(zhì)蛋白,融合蛋白,血凝素,和大聚合酶蛋白。與參考株之間的核苷酸同源性為87.2%?99.8%,其中發(fā)現(xiàn)CH/GDDG/2014株與China/XJYL/2013株同源性最高(99.8%),與KN5/2011同源性最低(87.2%)。小反芻獸疫病毒CH/GDDG/2014株與國內(nèi)近2年的小反芻獸疫病毒毒株均在系統(tǒng)進(jìn)化樹上處于同一分支,而與國外毒株處于不同分支。進(jìn)一步表明目前國內(nèi)流行的小反芻病毒親緣關(guān)系較近,且主要以IV系流行。構(gòu)建了PPRV的全長cDNA為拯救PPRV奠定了基礎(chǔ)。2.本研究成功構(gòu)建了小反芻獸疫N基因的重組穿梭質(zhì)粒pFastBac-PPRV-N,經(jīng)測序正確,轉(zhuǎn)化到DH10Bac大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞,經(jīng)過藍(lán)白斑篩選轉(zhuǎn)座后獲得重組桿狀病毒桿粒Bacmid-PPRV-N,轉(zhuǎn)染生長良好的Sf9細(xì)胞,獲取重組桿狀病毒。通SDS-PAGE和WB鑒定N的蛋白的表達(dá),且鑒定的條帶與預(yù)期的相符。
【學(xué)位授予單位】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:S852.65
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,本文編號:1137876
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