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UBASH3A基因單核苷酸多態(tài)性及其mRNA水平與類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎的相關(guān)性研究

發(fā)布時(shí)間:2017-11-02 09:18

  本文關(guān)鍵詞:UBASH3A基因單核苷酸多態(tài)性及其mRNA水平與類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎的相關(guān)性研究


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【摘要】:研究背景類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(rheumatoid arthritis,RA)是一種以持續(xù)性的滑膜炎、系統(tǒng)炎癥和自身抗體(特別是類風(fēng)濕因子和抗環(huán)瓜氨酸肽抗體)為特征的慢性系統(tǒng)性自身免疫性疾病,最終引起疼痛,關(guān)節(jié)變形和殘疾。在世界成年人口中,類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎的患病率大約為1%。目前,類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎確切的病因機(jī)制尚不清楚,致病因素多樣。有研究表明,RA的發(fā)病可能與遺傳因素、自身免疫耐受的破壞、感染因素、內(nèi)分泌異常及共同作用引起適應(yīng)性免疫和固有免疫紊亂有關(guān)。近年來(lái),從遺傳角度探索RA的發(fā)病機(jī)制成為相關(guān)研究的熱點(diǎn)。全基因組關(guān)聯(lián)研究(genome-wide association studies,GWAS)和候選基因研究已經(jīng)確定了50多個(gè)基因位點(diǎn)與RA的遺傳易感性有關(guān),家族聚集性及雙生子研究都表明遺傳因素是RA易感性的主要決定性因素。近年來(lái),新發(fā)現(xiàn)的泛素蛋白相關(guān)SH3結(jié)構(gòu)域A(Ubiquitin-associated and SH3domain-containing protein A,UBASH3A)作為蛋白酪氨酸磷酸酶(Protein tyrosine phosphatases,PTPs)家族中的一員被人們認(rèn)識(shí),UBASH3A也被稱為T(mén)細(xì)胞泛素配體(T-cell Ubiquitin Lig And,TULA)或T細(xì)胞信號(hào)抑制因子2(Suppressor of T-cell Signaling 2,STS-2)。UBASH3A基因主要在腎、脾、肺等器官及淋巴細(xì)胞中表達(dá),UBASH3A蛋白包含一個(gè)N-末端的與泛素相關(guān)的蛋白、Src同源3結(jié)構(gòu)域(Src Homology 3,SH3)及C-末端的磷酸甘油酸變位酶結(jié)構(gòu)域(Phosphoglycerate Mutase,PGM),如圖1所示。UBASH3A通過(guò)負(fù)調(diào)節(jié)T細(xì)胞受體介導(dǎo)的信號(hào)通路(T cell receptor,TCR),在調(diào)控免疫反應(yīng)中具有重要作用。已有多項(xiàng)研究表明UBASH3A基因與自身免疫性疾病的易感性相關(guān),如系統(tǒng)性紅斑狼瘡、類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎和甲狀腺功能亢進(jìn)等。目前,關(guān)于UBASH3A在RA的發(fā)病機(jī)制中的研究還較少,在中國(guó)漢族人群中,UBASH3A基因多態(tài)性及其外周血單個(gè)核細(xì)胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)中信使RNA(messenger RNA,m RNA)表達(dá)與RA的關(guān)聯(lián)目前還不清楚,因此,本研究通過(guò)收集RA病人和正常對(duì)照的血液標(biāo)本,采用病例對(duì)照研究,探討UBASH3A基因多態(tài)性與RA的疾病易感性之間的關(guān)聯(lián);同時(shí),檢測(cè)了PBMCs中UBASH3A基因m RNA表達(dá)水平,分析UBASH3A基因m RNA表達(dá)水平與RA不同臨床和實(shí)驗(yàn)室特征之間的關(guān)系,并且分析UBASH3A基因多態(tài)性與m RNA表達(dá)水平之間的關(guān)系。本研究分為2個(gè)部分。圖1 UBASH3A蛋白結(jié)構(gòu)示意圖Fig 1 Schematic view of UBASH3A protein structure研究一UBASH3A基因多態(tài)性與類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎的相關(guān)性研究目的比較UBASH3A基因(rs1893592、rs2277798、rs11203203)的等位基因頻率和基因型頻率在RA患者及對(duì)照組中的分布差異,探討其與中國(guó)漢族人群RA遺傳易感性的關(guān)系,并結(jié)合臨床資料分析其與RA主要臨床特征和實(shí)驗(yàn)室指標(biāo)之間的關(guān)系。方法本研究共納入RA患者557例,病例均符合美國(guó)風(fēng)濕病學(xué)會(huì)1987年修訂的RA分類標(biāo)準(zhǔn);健康對(duì)照954例,來(lái)自健康體檢中心。收集RA病例和對(duì)照的基本資料和臨床資料及抽取外周靜脈血,提取DNA凍存,利用Fluidigm 192.24 Dynamic Array儀,采用Taq Man探針進(jìn)行基因分型。利用SPSS11.0軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05。結(jié)果(1)UBASH3A基因3個(gè)位點(diǎn)基因型頻率分布在對(duì)照組均符合哈迪-溫伯格平衡(Hardy-Weinverg equilibriun,HWE)定律(rs1893592:χ2=1.454,P=0.228;rs2277798:χ2=1.217,P=0.270;rs11203203:χ2=1.347,P=0.246)。(2)研究結(jié)果顯示,UBASH3A基因位點(diǎn)rs1893592與RA遺傳易感性有統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)(A versus C:χ2=19.187,P0.001,OR=1.470,95%CI:1.237-1.748;AA+AC versus CC:χ2=11.119,P=0.001,OR=2.419,95%CI:1.439-4.066;AA versus AC+CC:χ2=7.815,P=0.005,OR=1.394,95%CI:1.104-1.760);rs2277798位點(diǎn)及rs11203203位點(diǎn)等位基因及基因型頻率在病例組和對(duì)照組中的分布差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。(3)UBASH3A基因rs11203203位點(diǎn)的基因型頻率在類風(fēng)濕因子(Rheumatoid Factor,RF)陽(yáng)性病例和RF陰性病例中的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.011);UBASH3A基因rs2277798位點(diǎn)的G等位基因與抗環(huán)瓜氨酸肽(Cyclic Citrullinated Peptide,CCP)抗體存在統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)(P=0.018,OR=1.642,95%CI:1.084-2.434);未發(fā)現(xiàn)UBASH3A基因rs1893592位點(diǎn)與主要臨床特征有統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)(P0.05)。結(jié)論UBASH3A基因位點(diǎn)rs1893592多態(tài)性可能與RA患病的遺傳易感性相關(guān);rs11203203位點(diǎn)可能與RA合并RF增加有關(guān);rs2277798可能與抗CCP抗體增加有關(guān)。提示UBASH3A基因可能增加RA的患病風(fēng)險(xiǎn)及影響其臨床表型。研究二UBASH3A基因m RNA水平與類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎的相關(guān)性研究目的比較RA患者組和正常對(duì)照組的UBASH3A基因m RNA表達(dá)水平的差異,分析其與RA臨床和實(shí)驗(yàn)室指標(biāo)以及疾病活動(dòng)度的關(guān)聯(lián),并分析RA患者中UBASH3A基因多態(tài)性與m RNA表達(dá)水平之間的關(guān)系。方法在研究一的研究對(duì)象中選取30例RA患者,31例健康對(duì)照。檢測(cè)PBMCs中UBASH3A基因的m RNA表達(dá)水平。采用Mann-Whitney U秩和檢驗(yàn)比較不同組間m RNA表達(dá)水平差異,利用Spearman相關(guān)分析UBASH3A基因m RNA表達(dá)水平與RA主要臨床特征之間的關(guān)系。利用SPSS11.0軟件分析數(shù)據(jù),檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05。結(jié)果(1)RA病例組PBMCs中UBASH3A基因m RNA表達(dá)水平低于健康對(duì)照組m RNA表達(dá)水平(P=0.001),各活動(dòng)組RA患者UBASH3A基因m RNA表達(dá)水平與緩解期RA比較差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。(2)RF陽(yáng)性病例組UBASH3A基因m RNA表達(dá)水平與RF陰性病例組比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.670);抗CCP抗體陽(yáng)性的RA病人與抗CCP抗體陰性的RA病人比較,UBASH3A基因m RNA表達(dá)水平差異也無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.353)。(3)對(duì)RA病例組UBASH3A基因m RNA表達(dá)水平與血沉(Erythrocyte Sedimentation Rate,ESR)、C反應(yīng)蛋白(C-Reactive Protein,CRP)、病程、發(fā)病年齡和疾病活動(dòng)度評(píng)分(Disease Activity Score of 28 joints,DAS28)的關(guān)系采用Spearman等級(jí)相關(guān)分析,未發(fā)現(xiàn)UBASH3A基因m RNA表達(dá)水平與ESR、CRP、病程、發(fā)病年齡和DAS28呈現(xiàn)相關(guān)性(P0.05)。(4)在RA患者中,未發(fā)現(xiàn)UBASH3A基因多態(tài)性(rs1893592、rs11203203和rs2277798)與UBASH3A基因m RNA表達(dá)水平有統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)(P0.05)。結(jié)論RA病例中UBASH3A基因m RNA表達(dá)水平降低,但未發(fā)現(xiàn)m RNA表達(dá)水平與UBASH3A基因多態(tài)性及主要臨床資料之間的關(guān)聯(lián)。此結(jié)果提示UBASH3A基因可能在RA發(fā)病中起到重要作用。
【關(guān)鍵詞】:類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎 UBASH3A基因 單核苷酸多態(tài)性 類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎 UBASH3A基因 信使RNA 單核苷酸多態(tài)性
【學(xué)位授予單位】:安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R593.22
【目錄】:
  • 英文縮略詞表5-7
  • 中文摘要7-11
  • 英文摘要11-16
  • 研究一 UBASH3A基因多態(tài)性與類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎的相關(guān)性研究16-38
  • 1 前言16-17
  • 2 材料與方法17-23
  • 3 結(jié)果23-35
  • 4 討論35-37
  • 5 結(jié)論37-38
  • 研究二 UBASH3A基因m RNA水平與類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎的相關(guān)性研究38-53
  • 1 前言38-39
  • 2 材料與方法39-45
  • 3 結(jié)果45-50
  • 4 討論50-52
  • 5 結(jié)論52-53
  • 參考文獻(xiàn)53-58
  • 附錄58-60
  • 致謝60-61
  • 綜述61-73
  • 參考文獻(xiàn)68-73
  • 附件73-76

【相似文獻(xiàn)】

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8 王云萍;改善病情抗風(fēng)濕藥周期聯(lián)合治療類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎療效觀察及其對(duì)外周血GITRL表達(dá)的影響[D];山西醫(yī)科大學(xué);2015年

9 李希明;炎性因子IL-17對(duì)類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎患者外周血淋巴細(xì)胞P-糖蛋白的調(diào)控研究[D];山西醫(yī)科大學(xué);2015年

10 朱凱;山東地區(qū)漢族人群類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎與IRF5基因多態(tài)性的關(guān)聯(lián)研究及Meta分析[D];山東大學(xué);2015年

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