甘薯耐旱和耐鹽基因的挖掘和表達(dá)分析
本文關(guān)鍵詞:甘薯耐旱和耐鹽基因的挖掘和表達(dá)分析
更多相關(guān)文章: 甘薯 轉(zhuǎn)錄組 耐旱基因 耐鹽基因 基因表達(dá)
【摘要】:甘薯是世界第7大糧食作物,具有產(chǎn)量高、營養(yǎng)豐富、耐干旱和鹽堿等優(yōu)點.通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法,基于國內(nèi)3個甘薯品種的綜合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中進行耐旱和耐鹽相關(guān)轉(zhuǎn)錄本序列的挖掘,共獲得238個轉(zhuǎn)錄本,隨機選取9條具有全長編碼序列的轉(zhuǎn)錄本進行PCR擴增、克隆和測序后,測定序列與組裝序列相似度均高于98%,表明轉(zhuǎn)錄本序列是可靠的.分析這些轉(zhuǎn)錄本在不同甘薯品種間的表達(dá)水平時發(fā)現(xiàn),耐旱基因在京薯6號中表達(dá)量普遍較高,而在徐薯18中則普遍偏低,而耐鹽相關(guān)基因的差異表達(dá)模式卻與之相反.利用數(shù)字基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)進一步分析耐旱和耐鹽基因在徐薯18的6個組織或生長發(fā)育階段中的差異和特異表達(dá),結(jié)果顯示:耐旱和耐鹽基因在成熟葉和膨大期塊根中相對于其他組織具有高表達(dá)且差異顯著.采用熒光定量PCR方法驗證結(jié)果表明,耐旱和耐鹽基因在徐薯18不同組織器官或發(fā)育階段表達(dá)情況與數(shù)字基因表達(dá)譜分析結(jié)果基本一致.
【作者單位】: 四川大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院四川省分子生物學(xué)與生物技術(shù)重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】: 甘薯 轉(zhuǎn)錄組 耐旱基因 耐鹽基因 基因表達(dá)
【基金】:國家科技支撐計劃項目(2007BAD78B03) 四川省“十一五”重點攻關(guān)項目(07SG111-003-1)
【分類號】:S531
【正文快照】: 1引言過去幾十年來,全球變暖帶來的環(huán)境壓力和土地污染已逐漸成為農(nóng)作物生長的主要問題[1],不同作物應(yīng)對各種非生物脅迫壓力的能力各異,在不同程度上影響著農(nóng)作物的產(chǎn)量和品質(zhì),從而影響全球糧食供應(yīng)[2].甘薯是傳統(tǒng)的高產(chǎn)救荒糧食作物,在全世界糧食生產(chǎn)中排名第7,具有便于種植
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,本文編號:1129985
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