高粱淀粉合成酶新基因SSV的鑒定與特征分析
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【摘要】:淀粉合成酶(SS)是植物淀粉生物合成過程中的關(guān)鍵酶之一,目前已鑒定并揭示功能的淀粉合成酶有5個亞型。為利用豐富的基因組數(shù)據(jù)鑒定高粱基因組里的淀粉合成酶新亞型基因,本文利用生物信息學(xué)和分子生物學(xué)方法,首次鑒定并分離了編碼高粱淀粉合成酶的新亞型基因Sb SSV,并對此基因的內(nèi)含子-外顯子結(jié)構(gòu)、表達(dá)特性等進(jìn)行了分析。結(jié)果顯示,該基因的全長ORF為2 097 bp,其外顯子數(shù)量、長度及內(nèi)含子的位置分布等與玉米和水稻的直系同源基因基本一致,推導(dǎo)的蛋白具有細(xì)菌糖原合成酶和植物淀粉合成酶特有的糖基催化和糖基轉(zhuǎn)移保守結(jié)構(gòu)域。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,Sb SSV與已知的SSIV亞型親緣關(guān)系最近,推測本研究鑒定的Sb SSV基因編碼高粱淀粉合成酶新亞型。定量PCR分析表達(dá)特性結(jié)果顯示Sb SSV主要在高粱葉片中表達(dá),其表達(dá)受光誘導(dǎo),具有晝夜節(jié)律特性。研究結(jié)果可為深入揭示和完善植物淀粉合成代謝機(jī)制,以及改良植物產(chǎn)量和品質(zhì)提供理論基礎(chǔ)。
【作者單位】: 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;四川農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院;濮陽市農(nóng)業(yè)科學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 高粱 淀粉 淀粉合成酶V 新基因鑒定
【基金】:國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(973)(2011CB100100、2014CB138202) 四川省教育廳項(xiàng)目(12ZA70)
【分類號】:S514
【正文快照】: 植物淀粉是自然界重要的貯藏多糖,是人類食物和動物飼料中最主要的能量物質(zhì)。植物貯藏淀粉主要在胚乳細(xì)胞的造粉體里合成,占成熟籽粒重量的70%以上[1]。根據(jù)結(jié)構(gòu)的差異,可將淀粉分為直鏈淀粉和支鏈淀粉。直鏈淀粉主要是以α-1,4-糖苷鍵連接的多糖鏈,其分子基本呈線形。支鏈淀
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,本文編號:1128114
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