本文關(guān)鍵詞：岷江百合LiGPAT基因的克隆及生物信息學(xué)分析

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【摘要】：為探索百合的耐鹽,耐寒和耐旱的抗性機(jī)理,本試驗選取了抗寒能力極強(qiáng)的岷江百合(Lilium regale)為材料,利用RT-PCR技術(shù)克隆得到了岷江百合的Li GPAT基因的ORF區(qū)序列,全長1 212 bp,編碼403個氨基酸,分子量約為45.4 k D,Gen Bank登錄號為JX524740。通過同源序列比對發(fā)現(xiàn),Li GPAT基因編碼的氨基酸與單子葉植物油棕GPAT基因編碼的氨基酸的一致性最高,達(dá)到67.17%。利用在線軟件SMART進(jìn)行分析,表明Li GPAT氨基酸在169~315序列存在一個Pls C結(jié)構(gòu)域,這就說明Li GPAT蛋白屬于�；D(zhuǎn)移酶家族成員,且所有的活性位點都位于這個區(qū)域,具有酰基轉(zhuǎn)移酶的活性。通過在線軟件TMHMM Server 2.0預(yù)測分析揭示Li GPAT氨基酸序列不存在跨膜區(qū)域,可能是一個可溶性蛋白。利用在線軟件Plant-m PLoc預(yù)測表明,Li GPAT蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位為葉綠體。
【作者單位】： 沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省生物技術(shù)重點實驗室設(shè)施園藝省部共建教育部重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 岷江百合 甘油--磷酸酰基轉(zhuǎn)移酶(GPAT) 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng) 生物信息學(xué)分析
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(31572150)資助
【分類號】：S682.29;Q943.2
【正文快照】： 岷江百合(Lilium regale)是多年生球根花卉,主(Glycerol-3-phosphate acyltransferase,GPAT)作為磷要分布在川西的岷江流域,耐寒,可以在-7℃下生脂酰甘油(PG)生物合成的關(guān)鍵酶,催化18:1-ACP或存,適宜北方大量栽培,又是百合雜交較好的親本之16:0-ACP,并將其轉(zhuǎn)移到甘油-3-磷酸的

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本文編號：1118854