本文關(guān)鍵詞：番茄AT-hook基因家族的鑒定及脅迫條件下的表達分析

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【摘要】：AT-hook蛋白家族在植物生長發(fā)育、器官構(gòu)建及逆境脅迫和激素信號應答中發(fā)揮重要作用。本研究在番茄基因組范圍內(nèi),利用生物信息學方法對番茄AT-hook基因家族的成員、分布、結(jié)構(gòu)和功能進行分析。結(jié)果表明,番茄AT-hook家族包含32個成員,分為3種類型,其中類型Ⅰ含有13個成員;遺傳進化分析表明番茄AT-hook基因成員與擬南芥家族基因具有相似分類。利用實時熒光定量PCR對番茄32個基因開展組織表達分析,結(jié)果表明AT-hook基因具有表達差異,主要在根和花中表達較高。氧化脅迫分析結(jié)果表明,32個基因受ABA、SA、鹽、高溫和低溫誘導表達,其中部分基因顯著上調(diào)或下調(diào)表達,很可能參與了番茄逆境脅迫條件下的防御應答反應。本研究結(jié)果將為番茄AT-hook家族基因的深入研究提供依據(jù),為進一步解析番茄AT-hook基因的功能奠定基礎(chǔ)。
【作者單位】： 暨南大學生命科學技術(shù)學院;廣東省農(nóng)業(yè)科學院蔬菜研究所;廣東省蔬菜新技術(shù)研究重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 番茄 AT-HOOK基因家族 生物信息學 基因表達 氧化脅迫
【基金】：國家自然科學基金項目(31301776) 廣東省省級科技計劃項目(2014A020208044、2015A030302040、2015B090906012) 農(nóng)業(yè)部現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)體系項目(CARS-25-G-36) 廣東省對外科技合作項目(2013B050800012) 廣東省科技廳條件建設項目(粵財教[2013]112號)
【分類號】：S641.2
【正文快照】： URL:http://www.cnki.net/kcms/detail/11.4996.S.20160128.1524.016.htmlAT-hook是一種新的DNA結(jié)合蛋白基序,普遍存在于細菌、真菌、哺乳動物和植物的DNA結(jié)合蛋白中,是以精氨酸-甘氨酸-精氨酸-脯氨酸(RGRP)4個殘基為中心保守基序[1],這個短的保守氨基酸序列對AT-hook蛋白結(jié)合

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 王柏柯;楊生保;余慶輝;徐明;王文魁;羅淑萍;;加工番茄種質(zhì)資源的SSR分析[J];植物遺傳資源學報;2014年01期

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 楊生保;李寧;楊濤;王柏柯;唐亞萍;王強;帕提古麗;張貴仁;余慶輝;;基于SSR標記的制干辣椒品種資源遺傳多樣性分析[J];分子植物育種;2015年04期

【二級參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前7條

1 熊美蘭;國內(nèi)外番茄育種動態(tài)及發(fā)展趨勢[J];長江蔬菜;1991年05期

2 金鳳媚;薛俊;郟艷紅;劉仲齊;;番茄遺傳資源的聚類分析研究[J];華北農(nóng)學報;2006年06期

3 王日升;李楊瑞;楊麗濤;李立志;方鋒學;李文嘉;;番茄栽培品種SSR標記和形態(tài)標記的遺傳多樣性分析[J];熱帶亞熱帶植物學報;2006年02期

4 宋建;陳杰;陳火英;劉楊;莊天明;;利用SSR分子標記分析番茄的遺傳多樣性[J];上海交通大學學報(農(nóng)業(yè)科學版);2006年06期

5 張勇;毛浩量;王柏柯;彭剛;甘中祥;李倍金;張錄霞;余慶輝;;幾個加工番茄新品種在不同地區(qū)的適應性研究[J];新疆農(nóng)業(yè)科學;2009年05期

6 王效寧;韓東飛;云勇;孟衛(wèi)東;嚴小微;楊慶文;;利用SSR標記分析海南普通野生稻的遺傳多樣性[J];植物遺傳資源學報;2007年02期

7 張赤紅;張京;趙會英;張云霞;李珍;Michael Baum;;應用SSR標記對61個國家大麥遺傳多樣性的研究[J];植物遺傳資源學報;2008年01期

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 ;Modeling the Hook Depth Distribution of Pelagic Longlining in the Equatorial Area of Indian Ocean[J];Journal of Ocean University of China;2012年04期

2 蔣恕;杉木Cunninghamia 1anceolata( Lamb.)Hook.開花結(jié)籽的解剖學觀察[J];南京林業(yè)大學學報(自然科學版);1980年01期

3 ;[J];;年期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 楊文;王新華;張立峰;單慶林;;低碳鋁鎮(zhèn)靜鋼連鑄頭坯hook結(jié)構(gòu)特征[A];第十七屆（2013年）全國煉鋼學術(shù)會議論文集（B卷）[C];2013年

2 ;Subcutaneous cyst and acromioclavicular joint fusion due to Wolter clavicular plate:Is the plate too strong?Is the hook too long?[A];2005年浙江省骨科學術(shù)會議論文匯編[C];2005年

3 姚雪;崔勝;;The M-T Hook Structure Dramatically Increases the Potency of HIV-1 Fusion Inhibitors to Overcome Drug-resistance[A];中國生物化學與分子生物學會第十一次會員代表大會暨2014年全國學術(shù)會議論文集——專題報告七[C];2014年

4 H.Thomas Tsai;;Characterization of Hook Cracks in Tubular Products and Countermeasures[A];2007中國鋼鐵年會論文集[C];2007年

5 ;Design and Implementation of Hidden Key Loggers Under.Net Platform[A];Information Technology and Computer Science—Proceedings of 2012 National Conference on Information Technology and Computer Science[C];2012年

6 Guo Chun;Jiang Chao-Hui;;Design and Implementation of a Process-Protecting System in Windows NT[A];proceedings of 2010 3rd International Conference on Computer and Electrical Engineering (ICCEE 2010 no.1)[C];2012年

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本文編號：1097917