本文關鍵詞：低溫誘導下蘋果花藥差異表達基因分析

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【摘要】：低溫處理是蘋果花藥培養(yǎng)誘導胚狀體形成的關鍵步驟,花藥中的小孢子在經過一定時間的低溫誘導后才能獲得胚性潛能。本文通過轉錄組測序的方法對低溫處理前和低溫處理30 d的蘋果花藥進行研究,分析低溫誘導條件下花藥中的差異表達基因。結果表明:轉錄組測序共得到10.90 Gb的Clean Data。基因表達分析結果顯示,共有4 105個基因發(fā)生差異表達,包括表達上調基因1 849個,表達下調基因2 256個。注釋到GO、COG、KEGG、Swiss-Prot和nr數(shù)據(jù)庫的差異表達基因分別有3 325個、1 504個、733個、2 993個和3 758個。差異表達基因主要富集在與糖類代謝和激素信號轉導有關的過程中,其中在淀粉和蔗糖代謝、植物激素信號轉導這兩個代謝通路中富集的差異表達基因最多。篩選出的差異表達基因中控制蔗糖合成、細胞分裂素、脫落酸和油菜素內酯信號轉導的相關基因表達量上調,控制淀粉合成、生長素信號轉導的相關基因表達量下調。差異表達基因的熒光定量PCR結果顯示測序結果和實際結果變化趨勢完全一致。由此可見,蘋果花藥經低溫誘導后,影響蔗糖、淀粉生物合成和生長素、細胞分裂素、脫落酸、赤霉素和油菜素內酯信號轉導相關基因的表達變化是影響小孢子獲得胚性潛能的關鍵。
【作者單位】： 山西大學生物工程學院;山西省農業(yè)科學院生物技術研究中心;山西省農業(yè)科學院果樹研究所;山西省農業(yè)科學院科研處;
【關鍵詞】： 蘋果花藥 胚狀體 轉錄組測序 差異表達基因 熒光定量PCR
【基金】：國家自然基金(31372033) 國家科技基礎性工作專項(2012,FY110100-5) 山西省青年科技研究基金(2015021153)~~
【分類號】：S661.1
【正文快照】： 收稿2015-10-21修定2016-01-28資助國家自然基金(31372033)、國家科技基礎性工作專項(2012,FY110100-5)和山西省青年科技研究基金(2015021153)。單倍體育種作為獲得純合基因型的一種有效手段,在果樹育種和遺傳特性分析中具有重要意義。關于蘋果單倍體的研究報道中,國外H?fer等

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