本文關(guān)鍵詞：西瓜bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族基因的鑒定及其在非生物脅迫下的表達(dá)分析

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【摘要】：利用生物信息學(xué)方法,在西瓜測序基因組97103中共鑒定出96個(gè)bHLH家族成員,其中有94個(gè)可以被定位到西瓜的11條染色體上。通過基因結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域序列保守性的預(yù)測,發(fā)現(xiàn)這些基因的序列長度和內(nèi)含子數(shù)量變化很大,但bHLH結(jié)構(gòu)域序列比較保守。用擬南芥中39條已知的bHLH蛋白序列和西瓜的96條bHLH蛋白序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果顯示西瓜的bHLH家族可以進(jìn)一步被分為11個(gè)亞族。運(yùn)用熒光定量實(shí)時(shí)PCR技術(shù),分析了該家族中21個(gè)基因在西瓜響應(yīng)非生物脅迫時(shí)的表達(dá)水平,結(jié)果表明,8個(gè)基因受低溫脅迫誘導(dǎo)表達(dá),13個(gè)基因受ABA脅迫誘導(dǎo)表達(dá),14個(gè)基因受鹽脅迫誘導(dǎo)表達(dá)。ClabHLH41在3種脅迫下表達(dá)量均顯著增加,說明其在低溫、ABA和鹽脅迫應(yīng)答中可能發(fā)揮著重要作用。
【作者單位】： 西北農(nóng)林科技大學(xué)園藝學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 西瓜 bHLH 全基因組鑒定 脅迫響應(yīng) 基因表達(dá)
【基金】：國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)資金項(xiàng)目(CARS-26-18)
【分類號(hào)】：S651
【正文快照】： b HLH(basic Helix-Loop-Helix,堿性螺旋 環(huán) 螺旋)轉(zhuǎn)錄因子家族普遍存在于真核生物中,因其含有螺旋 環(huán) 螺旋(Helix-Loop-Helix,HLH)結(jié)構(gòu)而被命名。b HLH保守結(jié)構(gòu)域約含有60個(gè)氨基酸,其N端為富含堿性氨基酸的DNA結(jié)合區(qū),C端為α螺旋1 環(huán) α螺旋(Ma et al.,1994)。第1個(gè)b H

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