云南蔗區(qū)甘蔗線條花葉病毒分離物NIa基因形成新簇
發(fā)布時間:2017-10-23 04:14
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【摘要】:【目的】利用NIa基因,闡明甘蔗線條花葉病毒(Sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)的種系發(fā)生關(guān)系,為預(yù)測SCSMV流行變異趨勢及科學(xué)防控提供理論依據(jù)!痉椒ā繌脑颇险釁^(qū)和國家甘蔗種質(zhì)資源圃采集感病樣品,RT-PCR擴(kuò)增獲得SCSMV NIa基因序列后,使用Splits Tree、RDP、Phy ML、Dna SP等軟件分析SCSMV中國分離物的系統(tǒng)發(fā)生、選擇壓力及基因流動等特征!窘Y(jié)果】共獲得23條SCSMV NIa基因序列。這些序列間未發(fā)生重組,云南蔗區(qū)的部分序列形成1個新簇,且云南蔗區(qū)與國家甘蔗種質(zhì)資源圃之間的基因交流不顯著。此外,選擇壓力分析表明,NIa基因受很強(qiáng)的負(fù)選擇壓力作用!窘Y(jié)論】與P1、HC-Pro和CP等基因類似,SCSMV在NIa基因上也包含5個簇;SCSMV云南分離物具有較高的遺傳多樣性和清晰的地理相關(guān)性。
【作者單位】: 揚(yáng)州大學(xué)園藝與植物保護(hù)學(xué)院;中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所 植物病蟲害生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所 云南省甘蔗遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】: 甘蔗線條花葉病毒 NIa基因 系統(tǒng)發(fā)生
【基金】:國家自然科學(xué)基金(31601604) 植物病蟲害生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放課題(SKLOF201518) 揚(yáng)州大學(xué)科技創(chuàng)新培育基金(2015CXJ043)~~
【分類號】:S435.661
【正文快照】: 甘蔗線條花葉病毒(Sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)屬于馬鈴薯Y病毒科(Potyviridae)禾本科病毒屬(Poacevirus)。該病毒首先在甘蔗花葉病株上發(fā)現(xiàn),自然條件下能夠侵染甘蔗、高粱和一些禾本科雜草[1 4]。SCSMV侵染甘蔗引起長短不一的線條形花葉癥狀,發(fā)生普遍時能夠引起甘
【相似文獻(xiàn)】
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1 楊蘭英,項(xiàng)瑜,魏寧生,,彭學(xué)賢;馬鈴薯Y病毒6kD和NIa基因轉(zhuǎn)化的煙草介導(dǎo)抗病性[J];西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);1996年02期
本文編號:1081543
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