本文關(guān)鍵詞：裸子植物psbA基因分子進(jìn)化式樣的研究

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【摘要】：為闡明裸子植物對陸生生境生態(tài)響應(yīng)的分子機制,以新近的裸子植物分類系統(tǒng)為指導(dǎo),基于psb A基因編碼全序列對4亞綱53種代表植物進(jìn)行分子進(jìn)化分析。首先,依據(jù)"放松分子鐘"模型重建裸子植物在時間尺度下系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系;其次,采用6個模型(MEC/JTT、MEC/cp REV、M5、M7、M8、M8a)估測氨基酸位點ω值,并對各模型結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計檢測;隨后,利用Bootstrap方法檢PSBA蛋白內(nèi)部氨基酸位點的共進(jìn)化動態(tài)。結(jié)果表明,系統(tǒng)樹提示的物種分化歷程支持前期分類結(jié)果;光合系統(tǒng)反應(yīng)中心核心PSBA蛋白有3個氨基酸位點(13、19和243)曾經(jīng)受正選擇壓力;PSBA蛋白內(nèi)部有多對氨基酸位點間構(gòu)成了共進(jìn)化網(wǎng)絡(luò)。因此,psb A基因編碼序列具有作為描繪裸子植物系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系標(biāo)記的潛力,PSBA蛋白部分位點經(jīng)歷了適應(yīng)性進(jìn)化,通過位點間共進(jìn)化網(wǎng)絡(luò)協(xié)同作用方式輔助裸子植物響應(yīng)陸生生境。
【作者單位】： 湖北中醫(yī)藥大學(xué)中藥資源與中藥復(fù)方教育部重點實驗室;湖北中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 裸子植物 響應(yīng) 機制 放松分子鐘模型 適應(yīng)性進(jìn)化 共進(jìn)化
【基金】：國家自然科學(xué)基金青年項目(31500260) 湖北中醫(yī)藥大學(xué)教育部重點實驗室科研啟動經(jīng)費(5114000914)資助~~
【分類號】：Q943
【正文快照】： 近年來,植物系統(tǒng)分類狀況出現(xiàn)了較大轉(zhuǎn)變[1],木賊綱(Equisetopsida)被用來總括全部陸生植物,約1026種裸子植物(Gymnosperms)被列入4亞綱(subclass)[2]:即蘇鐵亞綱(Cycadidae)、銀杏亞綱(Ginkgoidae)、買麻藤亞綱(Gnetidae)和松柏亞綱(Pinidae)。蘇鐵亞綱含1目2科,即蘇鐵目(Cyc

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1 黃瑤，，吳乃虎;粟PsbA基因5’未端非編碼區(qū)的結(jié)構(gòu)特征[J];Developmental & Reproductive Biology;1995年02期

2 黃瑤,吳乃虎;小米psbA基因5'末端非編碼區(qū)的結(jié)構(gòu)特征[J];生物工程學(xué)報;1996年02期

3 楊澤民,章群,謝數(shù)濤,韓博平,呂頌輝,Hodgkiss;Phaeocystis globosa與Phaeocystis antarctica葉綠體psbA基因的比較[J];海洋科學(xué);2005年01期

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1 闞志強;高溫強光對楊梅葉綠素?zé)晒夂蚉sbA基因表達(dá)的影響[D];浙江農(nóng)林大學(xué);2014年

本文編號：1077478