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高坡豬PRKAA1基因多態(tài)性檢測(cè)及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2017-10-22 07:00

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【摘要】:為了對(duì)PRKAA1基因的遺傳機(jī)理進(jìn)行更進(jìn)一步的研究,本試驗(yàn)以高坡豬為研究對(duì)象,利用PCR技術(shù)對(duì)PRKAA1基因的全部外顯子進(jìn)行克隆擴(kuò)增,并對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行正反向直接測(cè)序,運(yùn)用生物信息軟件進(jìn)行序列分析;結(jié)果表明,僅在第7外顯子75 bp處發(fā)現(xiàn)了A/G 1個(gè)單核苷酸突變位點(diǎn),且該位點(diǎn)突變導(dǎo)致氨基酸密碼子由CAA變?yōu)镃AG,所對(duì)應(yīng)編碼的氨基酸也由谷酰胺酸(Gln)變?yōu)榫彼?Arg),由于氨基酸的改變導(dǎo)致了PRKAA1基因的mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)和蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)發(fā)生了構(gòu)象改變。突變前后該蛋白分子量分別為136.152 k D和136.166 k D,PRKAA1蛋白無(wú)跨膜結(jié)構(gòu),不屬于分泌蛋白。本研究結(jié)果可為高坡豬的PRKAA1基因表達(dá)載體的構(gòu)建提供依據(jù)。
【作者單位】: 貴州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院高原山地動(dòng)物遺傳育種與繁殖教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;貴州省遵義市正安縣畜牧產(chǎn)業(yè)發(fā)展辦公室;貴州省畢節(jié)市農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)辦公室;
【關(guān)鍵詞】PRKAA基因 多態(tài)性 生物信息學(xué) 高坡豬
【基金】:“高坡豬種質(zhì)資源利用與高效養(yǎng)殖模式研究”黔科合NY字[2010]3050號(hào))項(xiàng)目基金資助
【分類(lèi)號(hào)】:Q953
【正文快照】: *通訊作者,ellenlihui@sina.cnPolymorphisms and Bioinformatics Analysis of PRKAA1 Gene in Gaopo PigZhang Rong1Li Hui1*Zhao Zhonghai1Shi Xiaoli1Yi Hengjie1,2Shi Xuan1Wang Chengdong1,31 Key Laboratory of Animal Genetics,Breeding and Reproduction in the Plate

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10 朱賢芳;生物序列的比對(duì)算法比較研究[D];南京理工大學(xué);2005年

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本文編號(hào):1077220

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