本文關(guān)鍵詞：水分脅迫下小麥TaWSI18基因的電子克隆及生物信息學(xué)分析

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【摘要】：利用電子克隆和RT-PCR技術(shù),從干旱脅迫的小麥葉片中分離出4條新的具有高度同源性的WSI18基因,即TaWSI18-1、TaWSI18-2、TaWSI18-3和TaWSI18-4(Gene Bank登陸號(hào)分別為:KP226849、KP226850、KP226851和KP226852);其開放閱讀框均為678 bp,編碼225個(gè)氨基酸。生物信息學(xué)分析表明,該類蛋白具有親水性,存在多個(gè)磷酸化位點(diǎn),無信號(hào)肽結(jié)構(gòu)域及剪切位點(diǎn),定位于細(xì)胞質(zhì)中,無跨膜結(jié)構(gòu)域;二級(jí)結(jié)構(gòu)分析表明,該蛋白α螺旋和無規(guī)則卷曲的比例達(dá)到90%以上;同源性比較及聚類分析表明,小麥TaWSI18蛋白同無芒雀麥(Bromus inermis,BAN15016)WSI18蛋白和二穗短柄草(Brachypodium distachyon,XP 003569641)LEA3蛋白具有高度的同源性,相似性分別為94%和70%。小麥TaWSI18基因編碼蛋白的氨基酸序列的N端存在與LEA蛋白的N端區(qū)域高度保守的序列。表明小麥TaWSI18蛋白的性質(zhì)與LEA3蛋白的相似,說明了小麥的TaWSI18蛋白可能與LEA3蛋白存在相同或相似的功能,為進(jìn)一步研究其在小麥水分脅迫下的功能奠定基礎(chǔ)。
【作者單位】： 西北農(nóng)林科技大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院旱區(qū)作物逆境生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 小麥 水分脅迫 TaWSI基因 電子克隆 生物信息學(xué)
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31071349) 高等學(xué)校博士學(xué)科點(diǎn)專項(xiàng)基金(20120204110033)
【分類號(hào)】：S512.1
【正文快照】： 小麥?zhǔn)俏覈饕募Z食作物,非生物脅迫會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞缺水,影響植物的生長發(fā)育,誘導(dǎo)多種基因表達(dá)[1],產(chǎn)生一系列重要的功能蛋白和調(diào)控蛋白,減輕水分脅迫對(duì)作物的損害。調(diào)控蛋白如轉(zhuǎn)錄因子、蛋白激酶等參與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和基因表達(dá)調(diào)控,調(diào)節(jié)細(xì)胞的新陳代謝、轉(zhuǎn)錄并對(duì)各種刺激產(chǎn)生應(yīng)答反，

本文編號(hào)：1073249