本文關(guān)鍵詞：胃癌基因芯片的差異表達(dá)基因研究

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【摘要】：目的:基因芯片是近二十年分子生物學(xué)領(lǐng)域發(fā)展起來(lái)的革命性技術(shù)之一,隨著表達(dá)譜芯片技術(shù)的成熟,產(chǎn)生了大量的基因芯片及海量的生物學(xué)信息。如何利用眾多實(shí)驗(yàn)室的基因芯片數(shù)據(jù)及從這些紛繁的基因表達(dá)數(shù)據(jù)中讀懂其中蘊(yùn)含的生物學(xué)意義是生物學(xué)工作者的挑戰(zhàn)與目標(biāo)。胃癌是世界性普遍的腫瘤之一,其在全球癌癥發(fā)病率中排名第四,致死率排名第二[1]。然而,人們對(duì)于胃癌的發(fā)病機(jī)制仍然不是十分清楚,對(duì)胃癌的生物學(xué),遺傳學(xué)和分子機(jī)制更好的理解將有助于我們發(fā)現(xiàn)治療這種疾病的新的方法。本研究利用基因芯片數(shù)據(jù),通過(guò)生物學(xué)軟件對(duì)基因芯片數(shù)據(jù)予以分析和研究,探索胃癌發(fā)病的分子機(jī)制。方法:從GEO下載GSE29272和GSE19826兩組基因芯片數(shù)據(jù),各組芯片數(shù)據(jù)均分為T(胃癌組織)和N(癌旁組織)2組。分別導(dǎo)入GeneSpring GX 11.5軟件進(jìn)行基因芯片數(shù)據(jù)分析,篩選差異表達(dá)基因。再使用Venny在線分析軟件得到GSE29272和GSE19826兩者的共同上調(diào)基因及共同下調(diào)基因。通過(guò)David軟件,對(duì)胃癌的差異表達(dá)基因進(jìn)行基因本體論及信號(hào)通路富集分析,結(jié)合文獻(xiàn)資料分析研究這些基因及信號(hào)通路等的功能及其在胃癌發(fā)生、發(fā)展中的作用。最后懫用Real-time PCR技術(shù)對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果:利用基因芯片數(shù)據(jù)篩選到差異表達(dá)基因91個(gè),其中56個(gè)基因的表達(dá)顯著上調(diào),35個(gè)基因的表達(dá)顯著下調(diào)(差異均在2倍以上)�；虮倔w論分析結(jié)果主要包括:細(xì)胞外基質(zhì)組成、細(xì)胞粘附、血管發(fā)育、膠原蛋白代謝等。信號(hào)通路富集分析結(jié)果主要包括:細(xì)胞外基質(zhì)受體相互作用(ECM-receptor interactions)、粘著斑(focal adhesion)信號(hào)通路。選取的COL1A1、COL1A2、COL3A1、FN1、THBS2的RT-PCR驗(yàn)證結(jié)果與基因芯片檢測(cè)結(jié)果一致,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)可靠。結(jié)論:細(xì)胞外基質(zhì)受體相互作用信號(hào)通路和粘著斑信號(hào)通路是胃癌的主要發(fā)病機(jī)制之一。
【關(guān)鍵詞】：胃癌 差異基因 基因芯片
【學(xué)位授予單位】：南華大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：R735.2
【目錄】：

• 摘要4-6
• Abstract6-9
• 第1章 前言9-13
• 第2章 材料方法13-23
• 第3章 結(jié)果23-35
• 第4章 討論35-39
• 第5章 結(jié)論39-41
• 參考文獻(xiàn)41-47
• 綜述47-51
• 參考文獻(xiàn)50-51
• 碩士期間發(fā)表的論文51-53
• 致謝53

【相似文獻(xiàn)】

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3 石s，

本文編號(hào)：1065304