本文關(guān)鍵詞：小麥脫水素基因WDHN1-2的克隆及其表達分析

  更多相關(guān)文章： 小麥 電子克隆 脫水素 生物信息學分析 半定量RT-PCR

【摘要】：為進一步明確小麥脫水素基因WDHN1-2在逆境條件下的功能,以傘穗山羊草DHN1基因為探針,通過電子克隆及RT-PCR技術(shù)獲得WDHN1-2基因后對其序列特征進行分析,同時利用基因表達綜合數(shù)據(jù)庫及半定量RT-PCR技術(shù)對該基因的表達模式進行解析。結(jié)果表明,WDHN1-2基因編碼區(qū)(CDS)長為548bp,編碼的氨基酸具有脫水素保守序列K、Y和S片段,與山羊草脫水素EMT25371親緣關(guān)系最近。WDHN1-2蛋白屬于穩(wěn)定且高度親水蛋白,二級結(jié)構(gòu)以α-螺旋和無規(guī)則卷曲為主;該蛋白在亞細胞中定位的可能性:過氧化物酶體細胞核線粒體基質(zhì),可能行使轉(zhuǎn)錄調(diào)控的功能。表達模式分析發(fā)現(xiàn),WDHN1-2基因在小麥開花后22d的胚乳中表達量最高,在ABA、PEG、NaCl及4℃低溫脅迫下表達量均先上升后下降。
【作者單位】： 西北農(nóng)林科技大學生命科學學院;西北大學生命科學學院;
【關(guān)鍵詞】： 小麥 電子克隆 脫水素 生物信息學分析 半定量RT-PCR
【基金】：旱區(qū)作物逆境生物學國家重點實驗室資助課題(CSBA2015007) 高等學校博士學科點專項科研基金項目(20120204110033)
【分類號】：S512.1
【正文快照】： 脫水素,即胚胎發(fā)育晚期豐富蛋白第二家族蛋白,能夠在植物胚胎發(fā)育晚期以及逆境脅迫(如低溫、干旱和高鹽等)下表達,部分脫水素的表達受到脫落酸(ABA)的誘導[1]。脫水素一般由85~574個氨基酸殘基組成,其分子量從9.6~200kDa不等[2-3]。脫水素富含極性氨基酸和親水性氨基酸(甘氨酸

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