本文關鍵詞：應用離散傅里葉變換的阿爾茨海默病基因數(shù)據(jù)的特征提取與候選基因分析

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【摘要】：阿爾茨海默病是一種神經(jīng)退行性疾病.目前科學工作者還未搞清楚致病機理.同時根據(jù)世界衛(wèi)生組織統(tǒng)計,截至2015年全世界約有四千八百萬名阿爾茨海默病患者.但是,隨著后基因組時代的到來,基因芯片技術為阿爾茨海默病的致病機理的研究提供了新的方向并且也取得了一些研究進展.由于基因芯片技術實驗的誤差以及實驗樣本的多樣性,則本文通過主成分分析方法從基因表達數(shù)據(jù)中提取到了特征集.并且假設人體的22283個基因為一個有序運行的系統(tǒng).則系統(tǒng)的這種有序運行結(jié)構(gòu)通過對基因表達數(shù)據(jù)的特征集作基因排序被給出.接下來,定義了基因的綜合貢獻被用來刻畫基因?qū)ο到y(tǒng)做出的貢獻.實驗數(shù)據(jù)表明系統(tǒng)的基因的綜合貢獻均呈現(xiàn)出波動的特征.同時,系統(tǒng)的系統(tǒng)熵和主軸熵隨著阿爾茨海默病的惡化也明顯增加了.基于上述特征,通過離散傅里葉變換方法本文設計了阿爾茨海默病的候選基因的識別算法.從而34個阿爾茨海默病的候選基因被提取出來以及它們的基因的綜合貢獻的變化情況也被呈現(xiàn)了出來.最后,候選基因分析表明阿爾茨海默病的候選基因大多分布于細胞核和細胞膜上,并且它們主要涉及到基因的調(diào)控轉(zhuǎn)錄和細胞的信號傳導功能.此外,5個候選基因與鋅離子、鈣離子有關系.并且結(jié)合阿爾茨海默病近30年的研究進展給出了本文篩選出的候選基因的功能通路圖,并且簡單的對比了之前預測的候選基因的研究結(jié)果.
【關鍵詞】：阿爾茨海默病 離散傅里葉變換 候選基因
【學位授予單位】：四川師范大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：R749.16
【目錄】：

• 摘要4-5
• Abstract5-9
• 1 緒論9-13
• 1.1 研究背景9-10
• 1.2 研究目的及意義10
• 1.3 本文的主要工作10-11
• 1.4 本章小結(jié)11-13
• 2 預備知識13-17
• 2.1 主成分分析方法13-14
• 2.2 信息熵14
• 2.3 離散傅里葉變換14-15
• 2.4 本章小結(jié)15-17
• 3 數(shù)據(jù)來源與特征17-25
• 3.1 基因數(shù)據(jù)來源17-18
• 3.2 數(shù)據(jù)特征 1：波動性18-22
• 3.3 數(shù)據(jù)特征 2：熵增22-24
• 3.4 本章小結(jié)24-25
• 4 應用離散傅里葉變換的候選基因識別25-31
• 4.1 候選基因識別算法25-27
• 4.2 實驗結(jié)果27-29
• 4.3 本章小結(jié)29-31
• 5 阿爾茨海默病候選基因分析31-35
• 5.1 阿爾茨海默病候選基因的位置與功能分布31-32
• 5.2 候選基因的通路圖分析32-33
• 5.3 本章小結(jié)33-35
• 6 總結(jié)與展望35-37
• 參考文獻37-41
• 附錄41-51
• 致謝51-53
• 在校期間發(fā)表的科研成果53

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 付如意;黃靜;胡本瓊;龐朝陽;;應用阿茲海默癥基因表達數(shù)據(jù)對比2種層次聚類方法[J];四川師范大學學報(自然科學版);2015年06期

2 黃靜;付如意;彭志紅;胡本瓊;龐朝陽;;基于阿爾茨海默病的基因表達數(shù)據(jù)改進的一維聚類方法[J];四川師范大學學報(自然科學版);2015年04期

3 王開軍;李曉;;基于有效性指標的聚類算法選擇[J];四川師范大學學報(自然科學版);2011年06期

4 莊劉;曾艷;;基于模糊C-均值聚類的最優(yōu)量化器設計[J];四川師范大學學報(自然科學版);2010年04期

5 吳斌;沈自尹;;基因芯片表達譜數(shù)據(jù)的預處理分析[J];中國生物化學與分子生物學報;2006年04期

6 胡本瓊,張先迪,龐朝陽;利用圖論設計圖像壓縮中的向量量化聚類算法[J];四川師范大學學報(自然科學版);2005年03期

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本文編號：1009205